WGCNA - 做专业的生信问答网站

登录

该问题已被锁定！

2: 关注

1508: 浏览

WGCNA

WGCNA

wgcna分析相关性为什么低.我尝试soft值2,6，感觉都很低

这是我按文章来分析出的图，相关性很低这是文章的图

好问题 0 评论收藏举报

查看全部 2 个回答

孟浩巍超级管理员用户来自于: 北京市
2023-05-18 14:35

1. 从h图看，好像分模块问题不是很大。

2. 选择6， 7， 8我感觉都差不多；

3. 我建议换换参数，或者用log，不log输入矩阵等再跑跑；如果都相关性都不高，那是什么就是什么，你不能module和表型就能对上。

赞同 0 0评论

关于作者

: 成中医 注册会员
这家伙很懒，还没有设置简介

0: 回答

0: 文章

1: 问题

问题动态

发布时间: 2023-05-18 14:08

更新时间: 2023-05-18 14:35

关注人数: 2 人关注

相关问题

WGCNA: 874 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

问题：如何筛选WGCNA分析得出的consensus module中的hub基因？: 962 浏览 2 关注 1 回答 1 评论

WGCNA中的TOM热图绘制: 961 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

[求助]WGCNA: 615 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

WGCNA图: 684 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

[求助]WGCNA具体参数: 560 浏览 1 关注 0 回答 2 评论

WGCNA筛选到感兴趣的模块后，如何找这个模块的hub基因呢？: 729 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

WGCNA: 1277 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

推荐内容

问 WGCNA中的TOM热图绘制: 961 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 WGCNA图: 684 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问问题：如何筛选WGCNA分析得出的consensus module中的hub基因？: 962 浏览 2 关注 1 回答 1 评论

问转录组数据样本聚类结果不理想: 819 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 [求助]WGCNA: 615 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 [求助]WGCNA具体参数: 560 浏览 1 关注 0 回答 2 评论

问 WGCNA: 874 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

问使用Tracking Tumor ImmunoPhenotype(TIP)网站分析TCGA的BLCA_tpm数据: 952 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

问 WGCNA筛选到感兴趣的模块后，如何找这个模块的hub基因呢？: 729 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

All Rights Reserved Powered BY WeCenter V4.1.0 © 2024