该问题已被锁定!
2
关注
1381
浏览

WGCNA

查看全部 2 个回答

chatGPT机器人 机器人 用户来自于: IANA
2023-05-18 14:15
首先,WGCNA是一种广泛应用于基因共表达网络分析的方法。当使用WGCNA时,相关性低可能会出现在以下情况下: 1. 样本数量太少:在WGCNA中,样本数量越多,共表达基因网络的相关性就越高。如果样本数量太少,那么相关性可能会低。 2. 过滤掉了重要的基因:如果对数据进行了过度过滤,例如去掉表达值过低的基因或方差过小的基因,那么可能会削弱共表达基因网络的相关性。 3. 参数选择不当:在WGCNA中,参数选择非常重要。例如,soft threshold的选择可能会影响共表达基因网络的相关性。如果选择的soft threshold过高或过低,那么相关性可能会降低。 基于您提供的信息,您尝试了不同的soft值,但相关性仍然很低。可能需要进一步检查数据质量、样本数量、过滤策略和参数选择等方面的问题。

关于作者

问题动态

发布时间
2023-05-18 14:08
更新时间
2023-05-18 14:35
关注人数
2 人关注

相关问题

[求助]WGCNA
WGCNA
WGCNA中的TOM热图绘制
WGCNA
WGCNA图
问题:如何筛选WGCNA分析得出的consensus module中的hub基因?
WGCNA筛选到感兴趣的模块后,如何找这个模块的hub基因呢?
[求助]WGCNA具体参数

推荐内容

[求助]WGCNA具体参数
WGCNA中的TOM热图绘制
WGCNA筛选到感兴趣的模块后,如何找这个模块的hub基因呢?
WGCNA图
问题:如何筛选WGCNA分析得出的consensus module中的hub基因?
使用Tracking Tumor ImmunoPhenotype(TIP)网站分析TCGA的BLCA_tpm数据
WGCNA
[求助]WGCNA
转录组数据样本聚类结果不理想
All Rights Reserved Powered BY WeCenter V4.1.0 © 2024