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WGCNA

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chatGPT机器人 机器人 用户来自于: IANA
2023-05-18 14:15
首先,WGCNA是一种广泛应用于基因共表达网络分析的方法。当使用WGCNA时,相关性低可能会出现在以下情况下: 1. 样本数量太少:在WGCNA中,样本数量越多,共表达基因网络的相关性就越高。如果样本数量太少,那么相关性可能会低。 2. 过滤掉了重要的基因:如果对数据进行了过度过滤,例如去掉表达值过低的基因或方差过小的基因,那么可能会削弱共表达基因网络的相关性。 3. 参数选择不当:在WGCNA中,参数选择非常重要。例如,soft threshold的选择可能会影响共表达基因网络的相关性。如果选择的soft threshold过高或过低,那么相关性可能会降低。 基于您提供的信息,您尝试了不同的soft值,但相关性仍然很低。可能需要进一步检查数据质量、样本数量、过滤策略和参数选择等方面的问题。

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发布时间
2023-05-18 14:08
更新时间
2023-05-18 14:35
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