SRA 数据批量下载

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GEO数据读入

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SRA、SRP、SRX、RUN等一些列NCBI genebank数据库中的一些缩略词官方解释或者全称，谢谢，虽然做了一段时间生信但是对这些小问题并没有重视，希望大家解答

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chip-seq数据下载有多个SRA

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进行转录组数据分析时，进行cuffdiff后的输出文件gene_exp.diff中，一个基因出现了两个不同的表达量数据，应该如何处理？

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使用MAS5.0处理过的芯片数据，能不能直接取对数后用limma包找差异表达基因，为什么不能？

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pheatmap画图的数据导入问题

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TCGA数据下载

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来自不同project的RNA-Seq数据可以直接合并分析吗？

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用log2(fold_change)数据做热图，遇到想要表达的目的基因log2(fold_change)值为inf或-inf时，怎么办？

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问 Closed Reference,Open Reference,Denovo聚类分析的联系和区别？

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问 常用的对测序序列进行聚类分析的软件有什么？及其使用的了什么算法？

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问 在N-W算法中，为什么忽略了从x状态道y状态的转化（xi对应到一个空位到yi对应一个空位的转化）

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