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通过富集得到了一些信号通路,我想看看这些通路里哪些是和癌症相关的,如何实现呢?

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Emile 初级会员 用户来自于: 北京市
2018-09-21 21:32
1. 看你是用什么数据集进行的富集分析,在数据原网站一般会有对通路的注释,例如前面答主提到的GSEA@ChoneWu; 2. 到KEGG和GO网站去检索,看对应通路的注释; 3. TCGA在今年上半年有分析致癌通路的文章,里面总结了10个致癌通路,可以看一下有没有你富集到的[url]https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/29625050[/url]   个人经验:与细胞周期,增殖,凋亡相关的通路大多与癌症相关,对于生信分析结果的解读需要较好的医学背景,建议找领域内的人讨论分析。  

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发布时间
2018-09-20 17:18
更新时间
2018-09-21 21:32
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