用ls *sra |while read id; do fastq-dump --split-3 $id;done命令，去解压缩sra文件，出现部分报错是什么原因？ - 做专业的生信问答网站

登录

该问题已被锁定！

3: 关注

3300: 浏览

用ls *sra |while read id; do fastq-dump --split-3 $id;done命令，去解压缩sra文件，出现部分报错是什么原因？

sra文件解压缩

另外问一下，大家是如何下载sra文件的，如何检测sra文件的完整性？下载源并没有对应的Md5检测文件呀！

好问题 0 评论收藏举报

查看全部 3 个回答

笨阿牛初级会员用户来自于: 安徽省合肥市
2018-09-18 08:42

已经解决了，用的是aspera

赞同 1 0评论

关于作者

: 笨阿牛 初级会员
这家伙很懒，还没有设置简介

14: 回答

0: 文章

17: 问题

问题动态

发布时间: 2018-09-17 17:53

更新时间: 2018-09-18 08:42

关注人数: 3 人关注

相关问题

关于gene id转换以及“org.Hs.eg.db"包（小剧场？）: 4228 浏览 4 关注 3 回答 0 评论

the accessibility of sgRNA binding to the target site是什么意思，有详细解答嘛: 2930 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

linux下使用convert出现报错，可能是什么原因？如何解决？: 3148 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

本地nt库blastn时添加staxid，taxid号一列显示N/A: 3079 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

不同种群的the overall synonymous diversity (πS)是什么意思: 2349 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

如何快速将基因名称转换为基因ID(拟南芥）: 2979 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

在GEO profile 下载sra文件，RunInfo Table 和accession list 有什么区别，下载哪个文件: 2213 浏览 1 关注 1 回答 0 评论

limma中的Removing heteroscedascity from count data和拟合线性模型是什么意思？: 1468 浏览 1 关注 0 回答 0 评论

安捷伦（Agilent）的数据处理软件Feature Extraction Software的默认的数据标准化的算法是什么？最后得到的值是否做了log2处理？是否是RMA或者MASS的一种？: 1421 浏览 1 关注 0 回答 0 评论

sgRNA的GC content 是什么意思，该如何计算: 3134 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

推荐内容

问双端测序的sra文件，经过fastq-dump --split-3，出现3个结果是什么原因？如下图: 2608 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

All Rights Reserved Powered BY WeCenter V4.1.0 © 2026