用ls *sra |while read id; do fastq-dump --split-3 $id;done命令，去解压缩sra文件，出现部分报错是什么原因？ - 做专业的生信问答网站

登录

该问题已被锁定！

3: 关注

2922: 浏览

用ls *sra |while read id; do fastq-dump --split-3 $id;done命令，去解压缩sra文件，出现部分报错是什么原因？

sra文件解压缩

另外问一下，大家是如何下载sra文件的，如何检测sra文件的完整性？下载源并没有对应的Md5检测文件呀！

好问题 0 评论收藏举报

查看全部 3 个回答

笨阿牛初级会员用户来自于: 安徽省合肥市
2018-09-18 08:42

已经解决了，用的是aspera

赞同 1 0评论

关于作者

: 笨阿牛 初级会员
这家伙很懒，还没有设置简介

14: 回答

0: 文章

17: 问题

问题动态

发布时间: 2018-09-17 17:53

更新时间: 2018-09-18 08:42

关注人数: 3 人关注

相关问题

奇异值分解在处理芯片数据时的意义是什么？: 1448 浏览 1 关注 0 回答 0 评论

chip-seq数据下载有多个SRA: 2555 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

aspera SRA 数据批量下载: 2782 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

riboseq中frame指的是什么，是如何确定的，通过riboseq如何知道一个基因的开放阅读框: 2252 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

【求助】如何确定一种基因ID的类型: 3516 浏览 4 关注 2 回答 0 评论

如何批量下载SRA数据库中的数据？: 2908 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

通过SRA编号寻找对应的文章: 1879 浏览 1 关注 1 回答 0 评论

关于gene id转换以及“org.Hs.eg.db"包（小剧场？）: 3607 浏览 4 关注 3 回答 0 评论

请问UCSC上下载的参考基因组中这个文件是什么含义: 1805 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

SRA、SRP、SRX、RUN等一些列NCBI genebank数据库中的一些缩略词官方解释或者全称，谢谢，虽然做了一段时间生信但是对这些小问题并没有重视，希望大家解答: 2412 浏览 1 关注 1 回答 0 评论

推荐内容

问双端测序的sra文件，经过fastq-dump --split-3，出现3个结果是什么原因？如下图: 2247 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

All Rights Reserved Powered BY WeCenter V4.1.0 © 2025