stringtie和gffcompare处理转录本的问题 - 做专业的生信问答网站

登录

该问题已被锁定！

2: 关注

697: 浏览

stringtie和gffcompare处理转录本的问题

官网说stringtie merge是对多个样本的转录本合并成一个非冗余的转录本。在做lncrna鉴定的时候，我到底是先合并再用gffcompare比较，还是先比较再合并。结果会不会不同

好问题 0 评论收藏举报

查看全部 1 个回答

孟浩巍超级管理员用户来自于: 北京市
2018-09-10 09:38

如果是鉴定新的lncRNA，应该是先compare再merge吧。

赞同 0 0评论

关于作者

: dk_bioinfo 注册会员
这家伙很懒，还没有设置简介

0: 回答

0: 文章

5: 问题

问题动态

发布时间: 2018-09-09 17:52

更新时间: 2018-09-10 09:38

关注人数: 2 人关注

相关问题

harmony整合样本前需要分别预处理吗？: 919 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

单细胞转录因子: 776 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

请问无参转录组的GO分析如何进行: 1417 浏览 7 关注 6 回答 0 评论

奇异值分解在处理芯片数据时的意义是什么？: 651 浏览 1 关注 0 回答 0 评论

chromosome名称转换的批量处理: 731 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

stringtie 得到的gtf 通过DESeq2分析后stringtieID 如何转换成esmbleID: 746 浏览 3 关注 2 回答 0 评论

在riboseq分析中，如何对没有起始密码子和终止密码子的转录本进行三碱基准确性分析？: 710 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

转录组: 764 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

麻烦问下，转录组差异分析，我需要筛掉比对率低的bam文件或者外显子比对率的样本吗: 898 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

转录本坐标转换成基因组坐标: 1097 浏览 4 关注 2 回答 0 评论

推荐内容

问 Stringtie报错: 720 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 lnc筛选: 554 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

All Rights Reserved Powered BY WeCenter V4.1.0 © 2024