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rMATS是如何得到外显子的两种isform的?
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rMATS是如何得到外显子的两种isform的?
可变剪切
rMATS比较差异是通过比较exon inclusion level 而exon inclusion level是通过exon skipping 和inclusion 两种isform计算的 ,那么这两种isform是怎么得到的呢?一条reads一条reads的去数嘛?
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孟浩巍
超级管理员
用户来自于: 北京市
2018-09-08 10:22
rMATS检测的可变剪切主要分成下面5种: [attach]165[/attach] 在检测的时候,需要提供gtf文件,然后通过判断read跨越junction的情况来判断。就是1条reads,1条reads的去数。
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发布时间
2018-09-07 12:01
更新时间
2018-09-08 10:22
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