请问大家都是用什么做KEGG功能注释的呢 - 做专业的生信问答网站

登录

该问题已被锁定！

2: 关注

1355: 浏览

请问大家都是用什么做KEGG功能注释的呢

kegg功能注释

像是GO注释可以用blast2go本地化注释然后用wego富集分析，那KEGG用什么注释呢。。测序物种不是模式物种如果直接用[size=15]clusterProfiler的话，这个R包是不是只支持一些物种呢。[/size]

好问题 0 评论收藏举报

1 回答

孟浩巍超级管理员用户来自于: 北京市
2018-09-02 10:33

其实道理类似，就是先找到你这个物种geneA 对应的模式生物的geneB, 一般寻找的过程是blast。然后再通过模式生物的geneB进行KEGG或者是GO分析。 blast2GO就是简化了这个过程，但是道理还是这么个道理。

赞同 0 0评论

关于作者

: bucongfan 注册会员
这家伙很懒，还没有设置简介

0: 回答

0: 文章

2: 问题

问题动态

发布时间: 2018-09-01 16:43

更新时间: 2018-09-02 10:33

关注人数: 2 人关注

相关问题

【提问】大家在精读一篇文献的时候有好句，好思路或者可用的新方法怎么进行知识整理呢？: 1541 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

先埋一个帖子，希望一年之后大家都能收获到自己想要的。: 3769 浏览 11 关注 10 回答 0 评论

NIPT算出了z-score后想要基于z>3的值对Z值进行校正该用什么方法: 1932 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

limma中的Removing heteroscedascity from count data和拟合线性模型是什么意思？: 928 浏览 1 关注 0 回答 0 评论

GO、KEGG分析中的showCategory是按照什么顺序来输出对应的条目的: 2613 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

请问hisat2+stringtie+deseq2的标准流程: 2579 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

用GWAS筛选受选择基因，样本数量不够，请问可以用选择消除分析吗: 1551 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

riboseq中frame指的是什么，是如何确定的，通过riboseq如何知道一个基因的开放阅读框: 1740 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

请问哪位老铁有ADMIXTURE的软件包吗？原网址UCLA的软件下载界面访问不了: 2248 浏览 3 关注 2 回答 0 评论

GWAS和WGS的选择消除分析有什么区别呀？: 1659 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

推荐内容

问 KEGG结果为空？: 2387 浏览 2 关注 3 回答 0 评论

问 GO、KEGG分析中的showCategory是按照什么顺序来输出对应的条目的: 2613 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

All Rights Reserved Powered BY WeCenter V4.1.0 © 2025