首页
问答
文章
专栏
大咖
更多
话题
帮助
请输入关键字进行搜索
查看更多 "
" 的搜索结果
登录
测了实验组与对照组的mRNA与miRNA的转录组,miRNA-mRNA互作分析网络怎么处理呢?
关注问题
回答问题
该问题已被锁定!
2
关注
1446
浏览
测了实验组与对照组的mRNA与miRNA的转录组,miRNA-mRNA互作分析网络怎么处理呢?
Cytoscape
生信分析
miRNA_mRNA互作分析
差异miRNA 几十个, 差异mRNA 有3000多个? 现在思路:1 . miRNA靶基因预测 与实际测序有差异的mRNA取交集, 然后找出miRNA-mRNA调控对,但是这个Cytoscape做出来节点有600多个,图根本就看不出来有什么意义。 各位大神是否有类似的分析思路给点建议? 或者有miRNA-mRNA互作分析的建议呢? 蟹蟹~~
阅读全文
收起全文
关注问题
回答问题
邀请回答
好问题
0
评论
收藏
举报
分享
复制链接
新浪微博
腾讯空间
微信扫一扫
展开
收起
0
评论
为什么被折叠?
0 个回复被折叠
2
回答
热门排序
最新排序
热门排序
只看楼主
孟浩巍
超级管理员
用户来自于: 北京市
2018-08-24 22:55
不知道你是什么物种,因为动物和植物的miRNA还是挺不一样的,这里我以动物的miRNA为例。 1. miRNA几乎都是1对多的调控,甚至出现1个对几百个gene的情况; 2. 一般动物里面常用targetScan的结果当做miRNA的靶标预测结果,里面有打分,打分的高低显示gene可能受miRNA调控的保守程度。一般认为,1个miRNA对1个gene的分数越高,越可能调控这个gene。 因此,我建议,你可以选择打分比较高的,比如top10的gene去做下游的挖掘,是不是更有可能?
阅读全文
收起全文
赞同
1
1
评论
分享
复制链接
新浪微博
腾讯空间
微信扫一扫
1
评论
海王坑
前台管理员
用户来自于: 湖北省武汉市
2018-08-24 21:51
这个还是得基于具体的生物学意义去分析互作网络,去看别人文献吧
阅读全文
收起全文
赞同
0
1
评论
分享
复制链接
新浪微博
腾讯空间
微信扫一扫
1
评论
关于作者
桶桶要好好学习
初级会员
这家伙很懒,还没有设置简介
1
回答
0
文章
4
问题
问题动态
发布时间
2018-08-24 16:16
更新时间
2018-08-24 22:55
关注人数
2 人关注
相关问题
怎么准确提取某一基因的ATG起始密码子位点
1460 浏览
2 关注
1 回答
0 评论
利用GATK的HaplotypeCaller生成GVCF一直报错怎么回事
1670 浏览
2 关注
2 回答
0 评论
怎么对基因启动子含有什么元件进行分析
1242 浏览
2 关注
1 回答
0 评论
生信问题(我也不知道该怎么问)
1809 浏览
2 关注
1 回答
0 评论
求助 limma计算DEG最后结果中的调整p值没有小于0.01的怎么办。。。
1085 浏览
2 关注
1 回答
0 评论
用log2(fold_change)数据做热图,遇到想要表达的目的基因log2(fold_change)值为inf或-inf时,怎么办?
1324 浏览
2 关注
1 回答
0 评论
R语言安装"MotIV"软件包,出现如下报错怎么办?
1208 浏览
2 关注
1 回答
0 评论
怎么从ncbi上下载gbff格式的文件
1582 浏览
2 关注
1 回答
0 评论
怎么画snp密度在染色体上的分布图,例图如下
1522 浏览
3 关注
2 回答
0 评论
关于ceRNA网络构建的后续分析有哪些?
1030 浏览
2 关注
1 回答
0 评论
推荐内容
问
Monocle3绘制自定义轨迹错误
1884 浏览
2 关注
1 回答
0 评论
问
关于基因间的相关性分析
1573 浏览
2 关注
2 回答
0 评论
问
用GWAS筛选受选择基因,样本数量不够,请问可以用选择消除分析吗
1144 浏览
2 关注
1 回答
0 评论
问
关于RSEM和RPKM
1110 浏览
2 关注
1 回答
0 评论
问
转录组组内样本差异大
1330 浏览
2 关注
1 回答
0 评论
问
高度杂合变异材料的遗传变异研究采取方法讨论
1134 浏览
2 关注
1 回答
0 评论
问
ATAC-seq不同测序量样本的差异比较
1601 浏览
2 关注
1 回答
0 评论
问
微生物群体分析中 adonis, anosim 问题
1858 浏览
2 关注
1 回答
0 评论
问
请问cytoscape是怎么构建网络的?
1136 浏览
3 关注
1 回答
0 评论
All Rights Reserved Powered BY
WeCenter V4.1.0
© 2025
关于我们
社区规范
你的浏览器版本过低,可能导致网站部分内容不能正常使用!
为了能正常使用网站功能,请使用以下浏览器
Chrome
Firefox
Safari
IE 10+