rna-seq数据校正 - 做专业的生信问答网站

登录

该问题已被锁定！

2: 关注

2694: 浏览

rna-seq数据校正

生信问题

请问，rna-seq数据处理完之后发现gapdh的值差异较大，可以通过gapdh来校正其它基因的表达量吗？

好问题 0 评论收藏举报

2 回答

孟浩巍超级管理员用户来自于: 北京市
2018-09-27 14:39

一般来说，不这么办，表达量特别高的gene本身的表达量用RNA-Seq衡量就不是很准；如果真的要确定是否有变化，你需要选择多个内参然后进行qPCR。以实验的结果为准。还有一个办法是掺入spike-in，最常用的是ERCC序列。

赞同 2 0评论

i_thinking 注册会员用户来自于: 北京市
2018-09-27 15:04

好的，感谢孟老师

赞同 0 0评论

关于作者

: i_thinking 注册会员
这家伙很懒，还没有设置简介

5: 回答

0: 文章

4: 问题

问题动态

发布时间: 2018-09-26 09:49

更新时间: 2018-09-27 15:04

关注人数: 2 人关注

相关问题

单细胞RNA-seq分析流程: 2955 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

celseq2转换单细胞原始数据: 2849 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

GWAS 数据存储网站: 1420 浏览 1 关注 0 回答 0 评论

芯片数据的批次效应对差异表达基因的计算结果影响大不大？: 2236 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

SRR1924430的sra数据与hdf5提取的fastq不一致: 1566 浏览 1 关注 0 回答 0 评论

请问一下，R语言环境下，如何在dataframe数据中添加一个key列呢？具体描述见正文: 3707 浏览 4 关注 4 回答 1 评论

log2后的数据进行Wilcoxon秩和检验对结果存在什么影响？: 2922 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

SRA 数据批量下载: 3974 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

RNA-seq reads和表达量在转座子上的分布meta图: 2171 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

Hichip得到loop数据如何注释？: 2719 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

推荐内容

问如何根据Datamonkey中FUBAR的结果计算该基因的dn/ds值: 3894 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 qpAdm结果解读: 2933 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问使用Tracking Tumor ImmunoPhenotype(TIP)网站分析TCGA的BLCA_tpm数据: 2766 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

问基因和染色体，lncRNA，mRNA之间的关系是怎样的？: 1350 浏览 1 关注 0 回答 1 评论

问关于GO分析的问题: 1984 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问请问cytoscape是怎么构建网络的？: 2057 浏览 3 关注 1 回答 0 评论

问 RNA Seq中什么样的reads是chimeric reads？是不是多数的chimeric reads都是circRNA的？: 2349 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问启动子染色质开放性: 3100 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

All Rights Reserved Powered BY WeCenter V4.1.0 © 2026