rna-seq数据校正 - 做专业的生信问答网站

登录

该问题已被锁定！

2: 关注

2284: 浏览

rna-seq数据校正

生信问题

请问，rna-seq数据处理完之后发现gapdh的值差异较大，可以通过gapdh来校正其它基因的表达量吗？

好问题 0 评论收藏举报

2 回答

孟浩巍超级管理员用户来自于: 北京市
2018-09-27 14:39

一般来说，不这么办，表达量特别高的gene本身的表达量用RNA-Seq衡量就不是很准；如果真的要确定是否有变化，你需要选择多个内参然后进行qPCR。以实验的结果为准。还有一个办法是掺入spike-in，最常用的是ERCC序列。

赞同 2 0评论

i_thinking 注册会员用户来自于: 北京市
2018-09-27 15:04

好的，感谢孟老师

赞同 0 0评论

关于作者

: i_thinking 注册会员
这家伙很懒，还没有设置简介

5: 回答

0: 文章

4: 问题

问题动态

发布时间: 2018-09-26 09:49

更新时间: 2018-09-27 15:04

关注人数: 2 人关注

相关问题

如何下载指定文献的原始数据？？: 1852 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

不同测序平台的scRNAseq数据集整合（10✖️、smart-seq）: 2255 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

请问芯片数据分析的一般流程及涉及的常用算法？: 2603 浏览 2 关注 3 回答 0 评论

最新的cas9蛋白的sgRNA的数据集: 1871 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

求重测序不同群体示例数据: 1152 浏览 1 关注 0 回答 1 评论

单细胞RNA-seq分析流程: 2418 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

ATAC-seq与RNA-seq的联合分析: 1844 浏览 1 关注 0 回答 0 评论

RNA-seq reads和表达量在转座子上的分布meta图: 1824 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

chip-seq数据下载有多个SRA: 2376 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

公司双端测序的数据R1R2处理: 2781 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

推荐内容

问 grep 能不能指定匹配第多少列？: 2156 浏览 3 关注 2 回答 1 评论

问转录本坐标转换成基因组坐标: 3203 浏览 4 关注 2 回答 0 评论

问 sc-ATAC数据质控: 2407 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 de novo mutation检测和判断: 1705 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问启动子染色质开放性: 2696 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

问不同测序平台的scRNAseq数据集整合（10✖️、smart-seq）: 2255 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问如何按一个列表对基因型文件进行过滤，剔除不需要的样本？: 2626 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 infercnv运行报错: 5737 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 RNA Seq中什么样的reads是chimeric reads？是不是多数的chimeric reads都是circRNA的？: 2052 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

All Rights Reserved Powered BY WeCenter V4.1.0 © 2025