pacbio的bas.h5文件转为fastq后为啥变小了？

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pacbio的bas.h5文件转为fastq后为啥变小了？

测序数据难道不应该尽量节省存储空间吗？为什么我把pacbio的bas.h5文件转为fastq文件后，反而变小了？bas.h5格式文件有什么优势吗?

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孟浩巍超级管理员用户来自于: 北京市
2018-09-25 14:20

h5格式是带原始信号的，fastq只有质量值和序列信息，当然小很多。

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xsp 注册会员用户来自于: 俄罗斯
2018-09-28 08:45

我用vdb-dump解出来了PacBio的SRR1924430的完整的sra文件，emmm，内容很多，比fastq大很多，格式应该是同bas.h5相同或类似。一个sra文件大概能解出来十倍大的fastq(当然，不是我们熟知的fastq，我只是不知道应该管他叫啥，可能就是bas.h5吧)。如图 [attach]271[/attach] [attach]272[/attach]

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发布时间: 2018-09-25 14:17

更新时间: 2018-09-28 08:45

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