首页
问答
文章
专栏
大咖
更多
话题
帮助
请输入关键字进行搜索
查看更多 "
" 的搜索结果
登录
单细胞RNA-seq,如何计算不同cluster之间的相关性
关注问题
回答问题
该问题已被锁定!
2
关注
2988
浏览
单细胞RNA-seq,如何计算不同cluster之间的相关性
单细胞RNA_seq
该图描述的是单细胞RNA-seq中20个cluster之间的相关性比较,如果我用R中的cor函数计算相关性,我只能得到所有细胞之间两两比较的相关性。那么采用哪种评估标准,可以用一个值或一个向量代表一个cluster的身份,并得到图中这种cluster与cluster之间的相关性呢? [attach]248[/attach]
阅读全文
收起全文
关注问题
回答问题
邀请回答
好问题
0
评论
收藏
举报
分享
复制链接
新浪微博
腾讯空间
微信扫一扫
展开
收起
0
评论
为什么被折叠?
0 个回复被折叠
1
回答
热门排序
最新排序
热门排序
只看楼主
孟浩巍
超级管理员
用户来自于: 北京市
2018-09-20 21:55
你可以去看一下paper里是怎么计算的,无外乎就是这么几个思路: 1. 选择cluster细胞中的平均情况,然后计算; 2. 选择cluster细胞中的代表情况,然后计算; 3. 选择cluster细胞中的一些特征信息,然后计算;
阅读全文
收起全文
赞同
0
2
评论
分享
复制链接
新浪微博
腾讯空间
微信扫一扫
2
评论
关于作者
杨麻麻
注册会员
这家伙很懒,还没有设置简介
0
回答
0
文章
1
问题
问题动态
发布时间
2018-09-20 21:05
更新时间
2018-09-20 21:55
关注人数
2 人关注
相关问题
ciriRNA表达量如何计算?(更)
2617 浏览
2 关注
1 回答
0 评论
如何计算富集分析里的差异倍数
2353 浏览
2 关注
1 回答
0 评论
seurat包,如何调节大热图左侧的基因字体大小
3982 浏览
2 关注
1 回答
0 评论
芯片数据的批次效应 对 差异表达基因的计算结果 影响大不大?
2432 浏览
2 关注
1 回答
0 评论
RNA-seq差异分析
2652 浏览
2 关注
1 回答
0 评论
chipseq原始文件fastq如何截取DNA长度小于等于260bp进行后续mapping
3066 浏览
2 关注
2 回答
0 评论
linux系统下,R语言,安装软件包install.packages("units"),出现如下问题该如何解决?
3735 浏览
3 关注
3 回答
0 评论
perl的如何进行读取和循环的
2784 浏览
3 关注
2 回答
0 评论
用户如何涨积分?
2197 浏览
1 关注
1 回答
0 评论
stringtie 得到的gtf 通过DESeq2分析后stringtieID 如何转换成esmbleID
2721 浏览
3 关注
2 回答
0 评论
推荐内容
问
Monocle3绘制自定义轨迹错误
4081 浏览
2 关注
1 回答
0 评论
问
单细胞分析中在umap聚类(seurat, scanpy)有调整群位置的参数吗?
6283 浏览
2 关注
3 回答
0 评论
问
使用seurat包,导出特定cluster的细胞-基因counts矩阵。初始数据命名为pbmc
3411 浏览
2 关注
1 回答
0 评论
问
单细胞多样本熵分析样例代码
2833 浏览
2 关注
1 回答
0 评论
问
harmony整合样本前需要分别预处理吗?
3416 浏览
2 关注
2 回答
0 评论
问
关于scrublet的使用
4302 浏览
2 关注
1 回答
0 评论
问
去除批次效应选定靶标细胞群后如何进行亚群分析?
4081 浏览
2 关注
2 回答
0 评论
问
如何使用seqtk按照比例随机提取单细胞数据?
3598 浏览
2 关注
2 回答
0 评论
问
用scanpy做单细胞分析,如何去除周期细胞的影响
3935 浏览
2 关注
1 回答
0 评论
问
cellranger运行结果分析
2948 浏览
2 关注
1 回答
0 评论
All Rights Reserved Powered BY
WeCenter V4.1.0
© 2026
关于我们
社区规范
你的浏览器版本过低,可能导致网站部分内容不能正常使用!
为了能正常使用网站功能,请使用以下浏览器
Chrome
Firefox
Safari
IE 10+