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怎么寻找某个基因的不同可变剪切形式?
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怎么寻找某个基因的不同可变剪切形式?
可变剪切
如题,想寻找EZH2这个基因在患者中的可变剪切形式和对应的表达丰度,不知道用什么软件怎么看呢
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孟浩巍
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用户来自于: 北京市
2018-09-15 19:31
不同剪切形式,可以用UCSC genome browser去看,比如你说的这个gene [attach]220[/attach] 里面每一行就是1个转录本,就是不同的isoform。至于isoform的定量,现在都不准。你可以用cuffdiff或者stringtie那一套碰碰运气。
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ChaozhongLiu
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用户来自于: 美国
2018-09-15 02:22
我记得cufflinks配合cummeRbund可以做到
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mrfoolish
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这家伙很懒,还没有设置简介
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发布时间
2018-09-14 11:55
更新时间
2023-05-17 18:26
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