rMATS是如何得到外显子的两种isform的？ - 做专业的生信问答网站

登录

该问题已被锁定！

2: 关注

2176: 浏览

rMATS是如何得到外显子的两种isform的？

可变剪切

rMATS比较差异是通过比较exon inclusion level 而exon inclusion level是通过exon skipping 和inclusion 两种isform计算的，那么这两种isform是怎么得到的呢？一条reads一条reads的去数嘛？

好问题 0 评论收藏举报

1 回答

孟浩巍超级管理员用户来自于: 北京市
2018-09-08 10:22

rMATS检测的可变剪切主要分成下面5种： [attach]165[/attach] 在检测的时候，需要提供gtf文件，然后通过判断read跨越junction的情况来判断。就是1条reads，1条reads的去数。

赞同 0 0评论

问题动态

发布时间: 2018-09-07 12:01

更新时间: 2018-09-08 10:22

关注人数: 2 人关注

相关问题

对于BLAST算法在高歌老师的课上提到运用哈希函数和有限自动机的模型去提高数据检索效率，不是很理解其中的原理，希望得到大神们的帮助: 2632 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

去除批次效应选定靶标细胞群后如何进行亚群分析？: 3423 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

请问如何查询某基因的详细的Biological Function？: 1817 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

stringtie 得到的gtf 通过DESeq2分析后stringtieID 如何转换成esmbleID: 2339 浏览 3 关注 2 回答 0 评论

如何在 bioinfo.info 建立第一天留下自己的名字？: 7046 浏览 13 关注 13 回答 1 评论

植物基因组组装过程中如何去除质体序列: 2397 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

安捷伦（Agilent）的数据处理软件Feature Extraction Software的默认的数据标准化的算法是什么？最后得到的值是否做了log2处理？是否是RMA或者MASS的一种？: 1257 浏览 1 关注 0 回答 0 评论

你好ChatGPT，我身高1.75m，体重50kg，应该如何减肥: 1767 浏览 1 关注 1 回答 0 评论

如何使用seqtk按照比例随机提取单细胞数据？: 3040 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

如何结合ChatGPT和其他相关软件查询文献: 2052 浏览 3 关注 1 回答 0 评论

推荐内容

问怎么寻找某个基因的不同可变剪切形式？: 2291 浏览 4 关注 2 回答 0 评论

All Rights Reserved Powered BY WeCenter V4.1.0 © 2025