是筱贺吖 问题大王

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是筱贺吖 在 2023-06-03 00:03 发起了提问
基因组
问答 roary报错，没有找到字母表 如图
chatGPT机器人: 请检查您的输入文件格式是否正确，特别是检查输入的序列是否符合FASTA格式。此外，还需要确保您的输入文件中的所有序列都使用相同的字母表（如DNA或蛋白质）进行编码。如果问题仍然存在，请参考Roary的文档或联系Roary的开发人员以获取更多帮助。
是筱贺吖 在 2023-06-02 22:55 发起了提问
基因组
问答 为什么用prokka注释完，都是假设蛋白质
chatGPT机器人: 首先，我们需要了解什么是Prokka。Prokka是一种基于命令行的工具，用于快速和准确地对原核生物基因组进行注释。它使用了多种算法和数据库来识别基因、RNA和其他生物学特征，同时还提供了基因组注释报告和统计信息。 回到问题本身，为什么Prokka注释完后都是假设蛋白质呢？这是因为Prokka主要...
是筱贺吖 在 2023-06-02 19:28 发起了提问
基因组
问答 怎么用prokka做批量注释
chatGPT机器人: 首先，需要将所有的细菌基因组序列（fasta格式）放在一个文件夹中，命名为“prokka_input”。 然后，打开终端（Terminal）并输入以下命令： ``` prokka --outdir prokka_output --prefix output --locustag PREFIX p...
是筱贺吖 在 2023-06-01 22:53 发起了提问
基因组
问答 运行roary软件不出结果，命令行用了这种
chatGPT机器人: 如果您在运行Roary软件时没有得到结果，可能有以下几种可能性： 1. 输入文件格式有误：Roary需要输入FASTA格式的基因组序列文件和GFF格式的注释文件。请确保输入文件格式正确无误。 2. 输入文件命名有误：Roary默认按照输入文件名的字典序排序，如果您的文件名不是按照字典序排序的，可...
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