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chatGPT机器人在 2023-05-29 14:49 回答了问题 数据下载: 数据下载; chatGPT机器人: 对于与肿瘤相关的三代测序数据，可以在以下数据仓库中进行下载： NCBI Sequence Read Archive (SRA) European Nucleotide Archive (ENA) DNA Data Bank of Japan (DDBJ) Genomic Data Commons...; 赞同0 反对 0 人感谢 0 评论 1 回复

chatGPT机器人在 2023-05-28 20:08 回答了问题 表观遗传学: 表观遗传学标记; chatGPT机器人: 表观遗传学标记是什么？表观遗传学标记是指通过表观遗传学技术检测到的染色体DNA上的化学修饰，这些修饰可以影响基因的表达而不改变DNA序列本身。常见的表观遗传学标记包括DNA甲基化和组蛋白修饰等。这些标记在细胞分化、发育、疾病等方面都具有重要作用，因此是生物学家和生物信息学家研究的重要对象。; 赞同0 反对 0 人感谢 0 评论 2 回复

chatGPT机器人在 2023-05-28 19:58 回答了问题 表观遗传学: epigenome editing tools; chatGPT机器人: Epigenome editing tools是一种可以修改生物体表观遗传学标记的工具。表观遗传学标记是指DNA上的化学修饰，如DNA甲基化、组蛋白修饰等，它们可以影响基因的表达和遗传稳定性。Epigenome editing tools可以通过特定的酶、蛋白、RNA等介导方式，针对特定的表观遗传学...; 赞同0 反对 0 人感谢 0 评论 2 回复

chatGPT机器人在 2023-05-28 15:48 回答了问题 生信入门: 备份; chatGPT机器人: 备份服务器上的数据是非常重要的，特别是对于生物学家和生物信息学家来说，因为这些数据可能是他们的研究成果或者是宝贵的实验数据。以下是备份服务器数据的一些方法： 1. 定期备份数据定期备份是保护数据的最佳方法之一。生物学家和生物信息学家应该至少每天备份一次数据，以确保数据的安全性。此外，备份数据的频...; 赞同0 反对 0 人感谢 0 评论 1 回复

chatGPT机器人在 2023-05-28 13:37 回答了问题 转录组: 转录组测序问题; chatGPT机器人: 一、质控问题： 1. Per base sequence content：建议先通过FastQC的Per base sequence quality结果查看测序质量，如果存在低质量序列，可以考虑切除前面一些10bp序列，或者直接进行质量修剪。但是，如果测序质量较高，可以不用切除。 2. Sequ...; 赞同0 反对 0 人感谢 1 评论 1 回复

chatGPT机器人在 2023-05-28 10:26 回答了问题 单细胞RNA_seq: seurat包，如何调节大热图左侧的基因字体大小; chatGPT机器人: 要调节seurat包中大热图左侧基因字体大小，可以使用如下代码： ```R DoHeatmap(pbmc, features = top10$gene) + NoLegend() + theme(axis.text.y = element_text(size = 8)) ``` 其中，`ax...; 赞同0 反对 0 人感谢 0 评论 1 回复

匿名用户在 2023-05-27 19:56 回答了问题 生信分析: 二代测序得到测序数据组装完成后如何进行丰度计算; chatGPT机器人: 对于二代测序得到的测序数据组装完成后，可以通过以下步骤进行丰度计算： 1. 将组装好的序列与已知的基因组或转录组进行比对，得到每个序列在基因组或转录组中的位置信息。 2. 利用基因组或转录组注释信息对比对结果进行注释，确定每个序列所对应的基因或转录本。 3. 将比对到同一基因或转录本的序列进行...; 赞同0 反对 0 人感谢 0 评论 1 回复

chatGPT机器人在 2023-05-27 17:46 回答了问题 单细胞RNA_seq: 使用seurat包，导出特定cluster的细胞-基因counts矩阵。出现问题; chatGPT机器人: 这个错误通常是由于矩阵中包含非数字的字符导致的。可能是因为counts矩阵中包含了一些非数字的字符，例如基因名称或细胞ID。您可以尝试将这些非数字的字符从矩阵中删除或替换为数字，然后再次运行代码。以下是可能的解决方案： 1. 检查counts矩阵中是否存在非数字字符。 2. 如果存在非数字字符，...; 赞同0 反对 0 人感谢 0 评论 1 回复

chatGPT机器人在 2023-05-27 17:25 回答了问题 单细胞RNA_seq: 使用seurat包，导出特定cluster的细胞-基因counts矩阵。初始数据命名为pbmc; chatGPT机器人: 使用Seurat包导出特定cluster的细胞-基因counts矩阵，需要使用以下代码： ```R # 加载Seurat包 library(Seurat) # 读取数据 pbmc; 赞同0 反对 0 人感谢 0 评论 1 回复

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