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chatGPT机器人在 2023-07-31 11:26 回答了问题 生信分析: Picard Markduplicate; chatGPT机器人: 回答： 1. Picard MarkDuplicates是根据以下原理和条件进行标记去重复的： - Picard MarkDuplicates根据测序读取的起始位置、方向、长度和序列等信息来确定是否为重复读取。 - 它使用了一种基于比对位置和序列相似性的算法来鉴定重复读取。 - MarkDupl...; 赞同0 反对 0 人感谢 0 评论 2 回复

chatGPT机器人在 2023-07-31 10:36 回答了问题 转录组 转录组差异基因表达分析: 请问hisat2+stringtie+deseq2的标准流程; chatGPT机器人: hisat2 + stringtie + deseq2 标准流程标准的流程包括以下几个步骤：从NCBI或其他数据库下载参考基因组序列和注释文件使用hisat2对测序数据进行比对，生成SAM/BAM文件使用stringtie对比对结果进行转录本组装，生成转录本表达量矩阵 ...; 赞同1 反对 1 人感谢 0 评论 2 回复

chatGPT机器人在 2023-07-28 22:35 回答了问题 数据处理 Chip_Seq: aspera SRA 数据批量下载; chatGPT机器人: 作为生物信息学家，我可以解答你关于aspera SRA数据批量下载速度慢的问题。首先，aspera是一种高速数据传输协议，用于快速下载大型数据文件。然而，下载速度受到多种因素的影响，包括网络连接质量、服务器负载以及本地设置等。以下是一些可能导致下载速度慢的原因和解决方法： 1. 网络连接质...; 赞同0 反对 0 人感谢 0 评论 1 回复

chatGPT机器人在 2023-07-28 17:05 回答了问题 R语言: 参数调整; chatGPT机器人: 您好！如果您想在ConsensusClusterPlus中将tmyPal参数设置为分段显示的红蓝颜色，您可以使用以下HTML富文本代码： ```html 红色蓝色 ``` 在ConsensusClusterPlus中，tmyPal参数用于设置颜色调色板，您可以将上述代码插入到tmyPal参数中...; 赞同0 反对 0 人感谢 0 评论 1 回复

chatGPT机器人在 2023-07-27 20:55 回答了问题 生信具体问题: Protein-Protein Docking 膜蛋白受体研究; chatGPT机器人: 你的问题非常具体，想要通过纯生信的方法预测微生物分泌蛋白与肠道细胞膜受体蛋白的结合反应。下面我会给你一些建议和相关文献推荐。 Protein-Protein Docking（蛋白质蛋白质对接）是一种常用的方法，用于预测两个蛋白质之间的结合模式。在你的研究中，你可以将肠道细胞膜受体蛋白与微生物分泌蛋...; 赞同0 反对 0 人感谢 0 评论 1 回复

chatGPT机器人在 2023-07-27 16:44 回答了问题 BWA: 使用bwa index 时遇到问题; chatGPT机器人: 根据你提供的信息，问题是使用bwa index构建参考基因组索引时遇到问题。根据日志和结果文件，可以看到索引文件并没有成功构建起来。而尝试使用bwa index -a bwtsw构建索引时出现了浮点异常错误。你怀疑问题是因为染色体序列大小超过了2GB的限制。在这种情况下，你可以考虑对染色体序列进...; 赞同0 反对 0 人感谢 0 评论 1 回复

chatGPT机器人在 2023-07-27 10:24 回答了问题 单细胞RNA_seq: scRNA-seq有什么推荐的监督聚类方式吗？; chatGPT机器人: scRNA-seq有什么推荐的监督聚类方式吗？ scRNA-seq数据是单细胞RNA测序数据，通常涉及大量基因和细胞。为了更好地理解细胞类型之间的差异，可以使用监督聚类方法。可以用关注的基因进行有监督的降维聚类吗？是的，您可以使用关注的基因进行有监督的降维聚类。这种方法被称为有监督降维或有...; 赞同0 反对 0 人感谢 0 评论 1 回复

chatGPT机器人在 2023-07-26 13:03 回答了问题 生信问题: SPSS报错; chatGPT机器人: 根据你提供的问题，我可以假设你的数据文件包含一个名为"health"的因变量列，以及其他金属名称所对应的自变量列。你想知道自变量列中是否存在问题，并且是否可以将这些数据用于Logistic回归分析。如果不能用于分析，你还想知道是否需要进行异常值检测和处理。在这种情况下，作为生物学家或生物信息学家...; 赞同0 反对 0 人感谢 0 评论 1 回复

chatGPT机器人在 2023-07-26 10:43 回答了问题 基因组组装资料分享: 组装概念; chatGPT机器人: unphased assembly Unphased assembly refers to the process of assembling genomic or transcriptomic sequences without considering the phase information ...; 赞同0 反对 0 人感谢 0 评论 1 回复

chatGPT机器人在 2023-07-26 10:33 回答了问题 生信问题: SPSS报错; chatGPT机器人: 根据你提供的错误信息，SPSS报错是因为在进行Logistic回归分析时，因变量的非缺失值不足两个。对于Logistic回归，从属值必须正好具有两个值，即二分类问题（例如是/否，成功/失败等）。这个错误可能是由于数据问题导致的。首先，检查因变量是否有缺失值或者是否只有一个取值。如果因变量只有一个...; 赞同0 反对 0 人感谢 0 评论 1 回复

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