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YDX 在 2018-09-22 22:51 发起了提问
生产分析
问答 根据基因表达做生存分析OS取出最合适的cutoff
如何计算生存分析高表达和低表达的最佳的分割点，我算了每个点对应的log-rank pvalue，找到了最小的，但这样往往发现两组的样本量严重不对称，一组有100多个，另一组不到10个。 我想请问选择最佳分割点应该有哪些限制:
YDX 在 2018-09-14 16:24 发起了提问
肿瘤 cutoff选择
问答 一个cohort中，某基因count大于多少才有意义？
比如说百分之多少的样本count要大于某个值:
YDX 在 2018-09-03 11:16 发起了提问
甲基化
问答 启动子区域甲基化位点选择
孟浩巍: 看你怎么计算了，如果你要计算的region正好包括两个点，那么取平均，取中位数，取最大值等等都可以，要看你说明的问题是什么。这里你简单处理的话，取平均就好。
YDX 在 2018-08-29 12:56 发起了提问
甲基化
问答 甲基化位点选择
孟浩巍: 1. 看你要研究什么问题，如果是想关注的问题比如转录起始，比如发育过程，那么关注TSS附近的就可以了。但是如果你想看global的变化，那肯定要所有的数据多分析。 2. 还是建议想清楚你要研究的问题，再用数据做探索~ 
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