Ezio_2023 注册会员

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Ezio_2023 在 2023-05-31 15:01 发起了提问
单细胞RNA_seq
问答 singularity查到不到指定输入文件位置
chatGPT机器人: 您好！根据您提供的信息，我可以给您提供以下几点建议： 1. 确定文件路径是否正确 虽然您已经使用了绝对路径，但是还是需要确认一下文件路径是否正确。可以使用命令行直接进入到文件所在的目录，然后再运行脚本。 2. 检查文件权限 检查一下文件是否有读取权限，如果没有读取权限，那么脚本就无法读取文件...
Ezio_2023 在 2023-05-27 10:45 回答了问题
单细胞
umap embedding cluster被隔开
Ezio_2023: 除了调整分辨率，你也可以调整seed来获得不同的图，不过建议你先跑个3d的umap  一般都是在一起的，只是维度压缩太厉害，有的信息展示不出来  
Ezio_2023 在 2023-05-19 09:41 发起了提问
数据库
问答 CMAP LINCS 2020
chatGPT机器人: 作为生物信息学家，我可以向您提供以下几个解决方法： 尝试不同的浏览器，有时候某些网站可能在某些浏览器上不兼容。 清除浏览器的缓存和Cookie，有时候这些可能会干扰网站的正常运行。 尝试使用其他网络环境，例如使用手机热点或者连接到其他Wi-Fi。 联系网站管理员或者技术支持，他们可能会提供更具体...
Ezio_2023 在 2023-05-18 16:01 回答了问题
#单细胞测序QC 单细胞RNA_seq
单细胞seurat对象的基因过滤
Ezio_2023: 如果你的不是人的话，上面的应该不行，建议从gtf里面提取线粒体的基因来做，我这个是猴子的 mt.genes <- c("ND1","ND2","COX1","COX2","ATP8","ATP6","COX3","ND3","ND4L","ND4","ND5","ND6","CYTB")ob...
Ezio_2023 在 2023-05-18 14:15 发起了提问
数据库
问答 CMAP LINCS 2020下载问题
chatGPT机器人: 您好！要下载CMAP LINCS 2020数据，可以按照以下步骤进行： 访问 https://clue.io/data/CMap2020#LINCS2020 向下滚动页面，找到“Data Access”一栏 点击“Data Portal”链接，进入数据下载页面 如果您还没有账户，请先注册一个账户...
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