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Czc 在 2018-10-14 14:07 发起了提问 生信工具使用 GSEA工具使用: 问答命令行下运行GSEA-3.0.jar的选项详解（最好能够有详细的帮助文档）

chatGPT机器人: 1、GSEA-3.0.jar的帮助文档可以通过在命令行输入以下命令获得：java -cp gsea-3.0.jar xtools.gsea.Gsea -help。这样可以得到GSEA-3.0.jar的详细帮助文档，包括各个参数的使用方法和说明。 2、chip选项是指使用哪种基因芯片。在GSEA分析...; 关注问题 1  1  0 评论

Czc 在 2018-10-04 10:32 发起了提问 生信具体问题: 问答如何提取比对上某一个基因或者某一段序列的所有reads

孟浩巍: samtools view 命令的使用说明如下： [code]Usage: samtools view [options] || [region ...] Options: -b output BAM -C output CRAM (requires -T) -...; 关注问题 2  0  0 评论

Czc 在 2018-10-03 14:02 回答了问题 数据库: SRA、SRP、SRX、RUN等一些列NCBI genebank数据库中的一些缩略词官方解释或者全称，谢谢，虽然做了一段时间生信但是对这些小问题并没有重视，希望大家解答; Czc: 233333，，好像自己在生信技能树上找到了答案 [url]http://www.biotrainee.com/thread-800-1-2.html[/url] [size=14]跟GEO类似.[/size] [size=14]NCBI的SRA（Sequence ReadArchive）数据库是抓...; 赞同1 反对 0 人感谢 1 评论 1 回复

Czc 在 2018-10-03 09:28 回答了问题 差异基因 RNA_seq: RNA-seq不同样本多个生物学重复不同处理条件下的如何找差异基因; Czc: 我同意楼上的说法，主要是看你想要什么样的结果，如果你是想要看treatment和non-treatment之间的不同就分三组做，你要是想看WT、OE-1、OE-2的就可以单独的拿这三组数据做，你要是想要看整体的，就很难计算了，我曾经做过四组之间的不同的差异表达分析，我当初的想法是这样的，就是A与B比...; 赞同2 反对 0 人感谢 0 评论 2 回复

Czc 在 2018-10-02 22:49 发起了提问 数据库: 问答 SRA、SRP、SRX、RUN等一些列NCBI genebank数据库中的一些缩略词官方解释或者全称，谢谢，虽然做了一段时间生信但是对这些小问题并没有重视，希望大家解答

Czc: 233333，，好像自己在生信技能树上找到了答案 [url]http://www.biotrainee.com/thread-800-1-2.html[/url] [size=14]跟GEO类似.[/size] [size=14]NCBI的SRA（Sequence ReadArchive）数据库是抓...; 关注问题 1  1  0 评论

Czc 在 2018-08-27 21:56 回答了问题 TCGA R语言 RStudio: 我的Rstudio所有的函数都是出现报错说没有某某某函数; Czc: 这样，先??函数名，查看是否属于这个包，然后载入相关package，然后实在不行就尝试重新安装该包，再就是不同包在安装的时候好像对一些依赖的编辑包会产生冲突，最好是在重新打开Rstudio然后在不载入其他package的情况下单独测试该包; 赞同0 反对 0 人感谢 2 评论 4 回复

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