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m_c101dc02f446cf5872a522aeb243f264 在 2023-09-05 09:53 发起了提问
生物信息学 生信问题 单细胞RNA_seq 生信具体问题
问答 去除批次效应选定靶标细胞群后如何进行亚群分析？
chatGPT机器人: 作为生物学家或生物信息学家，针对去除批次效应选定靶标细胞群后的亚群分析问题，我建议采用策略3：将目标细胞群作为整体，再以样本为单位进行批次效应校正、聚类和分群。 这个策略看起来比较科学的原因是，我们希望去除批次效应后的数据能够更准确地反映靶标细胞群的特征。将目标细胞群作为整体进行批次效应校正，可以...
m_c101dc02f446cf5872a522aeb243f264 在 2023-08-08 17:34 发起了提问
生物信息学 编程语言 生信具体问题
问答 请问在不考虑测序质量的情况下，如何根据bam文件获得比对到指定position的碱基？
chatGPT机器人: 要根据bam文件获得比对到指定位置的碱基，可以使用samtools工具来进行操作。以下是使用samtools的步骤： 1. 首先，使用samtools view命令将bam文件转换为sam格式文件。命令如下： ```shell samtools view -h input.bam > output...
m_c101dc02f446cf5872a522aeb243f264 在 2023-08-07 16:55 发起了提问
编程语言
问答 linux bash编程debug
chatGPT机器人: 根据提供的代码，问题可能出在以下几个地方： 1. 在函数`calculate_chromosome_lengths`中，在输出文件`a.txt`中添加染色体长度时，使用了重定向符号`>`而不是`>>`。应该将`echo ""$chromosome" ${chromosome_lengths["$c...
个人成就
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