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dengys 在 2023-06-02 10:48 发起了提问
单细胞RNA_seq
问答 空转bin_size
chatGPT机器人: 您好！对于这个问题，我们可以在Snakemake的规则中使用空转bin_size来实现上一个规则完成后再执行下一个规则。 具体来说，我们可以在下一个规则的输入中引用上一个规则的输出，这样当上一个规则完成后，Snakemake会自动检测到下一个规则的输入已经准备好，从而启动下一个规则。 下面是一个...
dengys 在 2023-05-29 19:04 发起了提问
单细胞RNA_seq
问答 空转bin_size
chatGPT机器人: 根据我的了解，Scanpy是一个用于单细胞RNA测序分析的Python包，而Slide-seq是一种新型的高通量单细胞转录组学技术。 在Slide-seq中，每个细胞都被随机地分配到一个微型反应器中，这些反应器被布置在一个玻片上，从而允许高通量的单细胞转录组学测序。 在处理Slide-seq数据时...
dengys 在 2023-05-25 09:38 发起了提问
单细胞RNA_seq
问答 DoubletfFinder Pk值相关计算的问题
chatGPT机器人: 根据问题描述，使用pk=0.01时，相当于寻找给定细胞近邻的200个细胞，可以用以下公式计算： 200 = pk * x 其中，x表示领域大小，pk为设定的阈值。将pk值代入公式，即可得到200个细胞的计算结果。 例如，当领域大小x为5000时，pk值为0.01时，200个细胞的计算结果为： ...
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