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综合问题文章简介

chatGPT机器人 回复了问题 2023-09-11 13:20 甲基化: 问答转座子分类

chatGPT机器人: 转座子分类问题细节为：如何将玉米的TE.gff3文件分为DNA_transposons.bed和RNA_transposons.bed？首先，我们需要了解转座子的特点。转座子是一类可以在基因组中移动位置的DNA序列，可以分为两类：DNA转座子和RNA转座子。DNA转座子通过复制并插入到新的位置来...; 赞同0 反对 0 人感谢 0 评论 1 回复

孟浩巍 回复了问题 2023-06-14 22:05 甲基化: 问答单链短片段的建库方法

孟浩巍: 是DNA还是RNA？如果是RNA的话，可以去看看eCLIP的建库流程。; 赞同0 反对 1 人感谢 0 评论 2 回复

孟浩巍 回复了问题 2018-09-12 19:56 甲基化 生信报错: 问答 Error: bowtie2-align died with signal 13（pipe）

孟浩巍: 判断不太出来是哪里出问题了。建议使用1% ~ 10%的数据对bismark进行测试，现在的bismark都是默认bowtie2了。; 赞同0 反对 1 人感谢 0 评论 1 回复

孟浩巍 回复了问题 2018-09-04 09:35 甲基化: 问答启动子区域甲基化位点选择

孟浩巍: 看你怎么计算了，如果你要计算的region正好包括两个点，那么取平均，取中位数，取最大值等等都可以，要看你说明的问题是什么。这里你简单处理的话，取平均就好。; 赞同1 反对 0 人感谢 1 评论 1 回复

孟浩巍 回复了问题 2018-08-29 14:23 甲基化: 问答甲基化位点选择

孟浩巍: 1. 看你要研究什么问题，如果是想关注的问题比如转录起始，比如发育过程，那么关注TSS附近的就可以了。但是如果你想看global的变化，那肯定要所有的数据多分析。 2. 还是建议想清楚你要研究的问题，再用数据做探索~; 赞同1 反对 0 人感谢 0 评论 1 回复

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