契卡 回复了问题 2018-10-13 19:54

rstudio_server

问答 windows10子系统安装Rstudio-server失败

契卡: 实验过了，会发生同样的报错。我搜了下在子系统、Docker下都有报错，很可能是这类环境的通病吧。

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海王坑 回复了问题 2018-10-01 12:36

R语言

问答 如何一个数据表中第一列都统一删除三个字母保留数字再输出为一个新表

海王坑: R语言： 用gsub()函数

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Emile 回复了问题 2018-10-01 06:51

python文件处理

问答 python怎么追加输出一列

Emile: 原生代码可以用双重循环构造二维列表，numpy包有转置函数T以及多种行列合并函数，pandas包可以像R一样添加列（ex. df[column_name] = result_list），最后再统一输出到文件。 行和列只是只是定义问题，对于这种结构化的数据，都可以把原来的列变量视为行变量，然后利用转...

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YIMUAXU 发起了提问 2018-09-30 20:39

多样性分析

问答 R软件里Bray-Curtis指数计算

求一个在R里计算的代码:

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邱风徐来 回复了问题 2018-09-26 14:04

ggplot2基础绘图

问答 如何批量绘制多条折线

邱风徐来: [code]> mat[,1:6] [,1] [,2] [,3] [,4] [,5] [,6] [1,] 1778 1.89192605 1778 3.0242247 1778 4.2449375 [2,] 1779 2.52550859 17...

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孟浩巍 回复了问题 2018-09-24 17:35

R

问答 求助，安装DESeq2遇到问题

孟浩巍: 试试在安装的时候这么安：  [code]>source("https://bioconductor.org/biocLite.R") >options(BioC_mirror="http://bioconductor.org") >biocLite("DESeq2")[/code]

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as160009071039 回复了问题 2018-09-21 17:13

R语言 画图

问答 请问如何使用R语言绘制散点图

as160009071039: 可是怎么画得跟他一样好看呢  

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孟浩巍 回复了问题 2018-09-21 11:31

blast

问答 blastp后，我想提取score的序列，请问使用python应该怎么写这个脚本

孟浩巍: 问题描述很清楚呀！我给你提供一个思路吧：   1. 建立dict, key是你的蛋白名，value 是一个list，长度为4 对应你的4个物种，里面需要存储你的分数值和蛋白名；   2. 开始循环，获得蛋白名，然后获得这个蛋白名对应的list，根据物种来比较分数，如果分数值大于list中存的分数就替...

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海王坑 回复了问题 2018-09-20 14:02

CHIpseeker

问答 ChIPseeker 报错

海王坑: covplot(F, weightCol="V5") 这一步能出图吗？不能的话，前面文件载入和包的问题 R语言里面方括号表示数组下标，看不懂你这F_peak

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sylar 发起了提问 2018-09-19 11:07

RNA_seq

问答 RNA-seq分析，rlog需要生物学重复才行？有别的Normalization方法吗？

[b]#Load data[/b] counts=read.csv("F:/data.csv", row.names=1, header=TRUE, check.names=FALSE) [b]#converting counts to integer mode[/b] colData = data...:

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fcdslz 发起了提问 2018-09-19 09:51

R语言

问答 求助：R语言中rm(list=ls())的函数化方式？

如题:

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孟浩巍 回复了问题 2018-09-18 15:46

R

问答 Rstudio安装R包时，出现unable to move temporary installation

孟浩巍: 66666666

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孟浩巍 回复了问题 2018-09-18 14:14

R数据处理

问答 请问一下，R语言环境下，如何在dataframe数据中添加一个key列呢？具体描述见正文

孟浩巍: 那我就给一个R语言的代码吧，比如： [code]> df df a b 1 m 1 2 n 2 3 k 3 4 p 4[/code]那么我们只需要： [code]> key = sprintf("%s.%s",df$a,df$b) > df$key = key > df a b key...

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刘上 回复了问题 2018-09-18 09:09

stringtie

问答 stringtie 得到的gtf 通过DESeq2分析后stringtieID 如何转换成esmbleID

刘上: 这是孟叔图片来源的转录组分析文章，以及自己整理的这篇文章的转录组分析流程

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SkiesShawn 发起了提问 2018-09-16 11:23

R Lolliplot

问答 Lolliplot

怎么用GenomicRanges/GRanges实现Lolliplot，进行突变位点的可视化？:

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