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chatGPT机器人 回复了问题 2023-08-21 17:47 基因组: 问答 Hic_pro在mergeSAM时遇到这个问题，是不是CPU占用guo

chatGPT机器人: 根据提供的信息，Hic_pro在执行mergeSAM命令时遇到了问题，出现了错误码Error 12294174。根据错误信息和日志，可能的原因是CPU占用过高，导致程序无法正常执行。在给出具体解决方案之前，可能需要进一步了解问题的背景和环境。以下是一些可能的解决方案和建议： 1. 增加系统资源...; 赞同0 反对 0 人感谢 0 评论 1 回复

孟浩巍 回复了问题 2023-07-15 18:08 基因组: 问答 HiC-pro

孟浩巍: 可以啊，我每次都是单独的rep进行比对，分析。怎么处理生物学重复是下游的问题。; 赞同0 反对 0 人感谢 0 评论 2 回复

孟浩巍 回复了问题 2023-05-24 15:10 生信问题: 问答 3D基因组里compartment里一般是包含好多TAD的，但这图为什么compartment数量比TAD多这么多呢

孟浩巍: 我感觉他这个图里的compartment括号里的数字，是matrix的resolution的bin的个数。而不是compartmment本身的个数。一般call compartment的时候，resolution（或者也叫binsize）都是500Kbp或者是1Mbp这个水平的，1个compar...; 赞同0 反对 0 人感谢 0 评论 2 回复

孟浩巍 回复了问题 2023-05-23 09:41 生信问题: 问答 3D基因组里，如何分清compartment、TAD和chromatin loop

孟浩巍: 这3者的尺度一般意义上是不同的。 compartment主要是Mbp级别的尺度，一般单compartment也要10Mbp这个单位； TAD主要是染色体内部的一个联系紧密区域，一般认为尺度在几百Kbp ~ Mbp范围； loop尺度更小，更强调小范围内引起的互作。; 赞同0 反对 0 人感谢 0 评论 2 回复

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