SNP请教

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利用GATK的HaplotypeCaller生成GVCF一直报错怎么回事

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是不是单细胞的chip-seq，cut run这些call peak是不需要对照的，我看代码里没有-c.所以Rna-seq的峰图也是不需要control来call peak的吗？

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运行gatk HaplotypeCaller的时候提示没有AVX加速

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求助GATK 说明书

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snippy calling 微生物snp

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macs2进行peak calling

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怎么画snp密度在染色体上的分布图，例图如下

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ATAC-seq数据多样本call peak如何合并？

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菌侵染植物的转录组分析中，若菌的一个基因在当前时间没有引起植物基因的变化，过了三个小时后才引起植物基因的变化，如何分析这种现象或如何将这一类基因关联起来，有没有类似的文献推荐？

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问 求助GATK 说明书

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问 运行gatk HaplotypeCaller的时候提示没有AVX加速

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问 利用GATK的HaplotypeCaller生成GVCF一直报错怎么回事

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