希望论坛设置一个新手入门专版

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菌侵染植物的转录组分析中，若菌的一个基因在当前时间没有引起植物基因的变化，过了三个小时后才引起植物基因的变化，如何分析这种现象或如何将这一类基因关联起来，有没有类似的文献推荐？

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最近在测试有一个可变剪切的软件，听说比rmats效果好

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请教一个问题，一个转录因子TF只会调控位于同一条链的基因，还是有可能调控反义链的基因？

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如何通过重测序方法找到大耳朵狗和小耳朵狗的候选基因如何通过重测序方法找到大耳朵狗和小耳朵狗的候选基因，目前已经把测序得到的数据map 到了染色体上，不知道下一步该怎么找候选基因

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怎么画snp密度在染色体上的分布图，例图如下

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先埋一个帖子，希望一年之后大家都能收获到自己想要的。

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求助一个shell脚本问题，如何批量处理下面这种情况？

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一个cohort中，某基因count大于多少才有意义？

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【求助】如何判断一个基因是否存在表观修饰的位点？

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