通过富集得到了一些信号通路，我想看看这些通路里哪些是和癌症相关的，如何实现呢？

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通过富集得到了一些信号通路，我想看看这些通路里哪些是和癌症相关的，如何实现呢？

癌症相关信号通路

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ChongWu 注册会员用户来自于: 广东省广州市
2018-09-21 14:41

生信新手小白回答，供参考：在做GSEA的时候，可以选择用MSigDB（[url=http://software.broadinstitute.org/gsea/msigdb/collections.jsp#C6）里的C4-CM]http://software.broadinstitute.org/gsea/msigdb/collections.jsp#C6[/url]）里的C4: computational gene sets-CM: cancer modules和C6: oncogenic signatures 这些gene set collections进行富集分析，这些gene sets都是与癌症相关的。

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发布时间: 2018-09-20 17:18

更新时间: 2018-09-21 21:32

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