请问大家都是用什么做KEGG功能注释的呢 - 做专业的生信问答网站

登录

该问题已被锁定！

2: 关注

1646: 浏览

请问大家都是用什么做KEGG功能注释的呢

kegg功能注释

像是GO注释可以用blast2go本地化注释然后用wego富集分析，那KEGG用什么注释呢。。测序物种不是模式物种如果直接用[size=15]clusterProfiler的话，这个R包是不是只支持一些物种呢。[/size]

好问题 0 评论收藏举报

查看全部 1 个回答

孟浩巍超级管理员用户来自于: 北京市
2018-09-02 10:33

其实道理类似，就是先找到你这个物种geneA 对应的模式生物的geneB, 一般寻找的过程是blast。然后再通过模式生物的geneB进行KEGG或者是GO分析。 blast2GO就是简化了这个过程，但是道理还是这么个道理。

赞同 0 0评论

关于作者

: bucongfan 注册会员
这家伙很懒，还没有设置简介

0: 回答

0: 文章

2: 问题

问题动态

发布时间: 2018-09-01 16:43

更新时间: 2018-09-02 10:33

关注人数: 2 人关注

相关问题

原核生物的转录组测序为什么比真核的贵？: 2654 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

NIPT算出了z-score后想要基于z>3的值对Z值进行校正该用什么方法: 2220 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

为什么单端测序的数据解压会出现多个文件？: 2281 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

请问hisat2+stringtie+deseq2的标准流程: 3109 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

请问一下，如何根据基因名批量下载CDS区的序列？: 2117 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

常用的对测序序列进行聚类分析的软件有什么？及其使用的了什么算法？: 2748 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

为什么差异基因分析会出现被KO的基因log2FC的数值大于1的情况: 2680 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

用ls *sra |while read id; do fastq-dump --split-3 $id;done命令，去解压缩sra文件，出现部分报错是什么原因？: 2650 浏览 3 关注 3 回答 0 评论

为什么单细胞测序需要对UMI去重而二代测序不需要去重？: 2640 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

我的Rstudio所有的函数都是出现报错说没有某某某函数: 2705 浏览 5 关注 4 回答 0 评论

推荐内容

问 KEGG结果为空？: 3047 浏览 2 关注 3 回答 0 评论

问 GO、KEGG分析中的showCategory是按照什么顺序来输出对应的条目的: 3222 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

All Rights Reserved Powered BY WeCenter V4.1.0 © 2025