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请问大家都是用什么做KEGG功能注释的呢
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请问大家都是用什么做KEGG功能注释的呢
kegg功能注释
像是GO注释可以用blast2go本地化注释然后用wego富集分析,那KEGG用什么注释呢。。测序物种不是模式物种 如果直接用[size=15]clusterProfiler的话,这个R包是不是只支持一些物种呢。[/size]
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孟浩巍
超级管理员
用户来自于: 北京市
2018-09-02 10:33
其实道理类似,就是先找到你这个物种geneA 对应的模式生物的geneB, 一般寻找的过程是blast。 然后再通过模式生物的geneB进行KEGG或者是GO分析。 blast2GO就是简化了这个过程,但是道理还是这么个道理。
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bucongfan
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这家伙很懒,还没有设置简介
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发布时间
2018-09-01 16:43
更新时间
2018-09-02 10:33
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