pheatmap画图的数据导入问题 - 做专业的生信问答网站

登录

该问题已被锁定！

3: 关注

1786: 浏览

pheatmap画图的数据导入问题

生信问题

请问下大家，我现在通过WGCNA得到了各个模块的基因名字，然后也通过代码获得了，每个颜色模块的基因的表达量，并且均一化。然后我要开始pheatmap画热图，但是在导入完数据，我用str（）命令查看数据类型发现是num和chr交替的，因此导致我后续pheatmap（）报错，报错内容为Error in x - m : non-numeric argument to binary operator 第一张图是我代码，第二张图是str（）之后看到数据是num和chr的，估计因此导致我后续pheatmap报错，第三张图为我的原始导入数据。恳请大佬帮我看看，哪里有问题，调整了一个晚上，还是没搞定。感激不尽

好问题 0 评论收藏举报

查看全部 2 个回答

孟浩巍超级管理员用户来自于: 北京市
2018-08-30 17:39

对你的数据进行一下处理就好了， new_df_exp.fix = as.numeric(new_df_exp[,c(-1,-2)]) rownames(new_df_exp.fix) = new_df_exp[,2] pheatmap(new_df_exp.fix)

赞同 0 1评论

关于作者

: sysuwinux 注册会员
这家伙很懒，还没有设置简介

1: 回答

0: 文章

3: 问题

问题动态

发布时间: 2018-08-30 17:10

更新时间: 2018-08-30 17:41

关注人数: 3 人关注

相关问题

GWAS 数据存储网站: 732 浏览 1 关注 0 回答 0 评论

log2后的数据进行Wilcoxon秩和检验对结果存在什么影响？: 1590 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

非靶向代谢组数据的PLS/OPLS模型Q2小于0.5，模型还可用吗？: 1465 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

使用seurat包，导出特定cluster的细胞-基因counts矩阵。初始数据命名为pbmc: 1543 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

HHblits使用相同的数据库，得出的结果明显差于HHpred网页版的结果。该如何使用HHsuite命令行得到与网页端类似的效果: 2143 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

用atac-seq数据计算的TSS enrichment score: 2062 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

linux bam数据替换: 1664 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

给我一份最新的cas9蛋白的sgRNA的数据集: 1645 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

公司双端测序的数据R1R2处理: 1652 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

GEO数据读入: 953 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

推荐内容

问使用Tracking Tumor ImmunoPhenotype(TIP)网站分析TCGA的BLCA_tpm数据: 1426 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

问 kraken2软件运行时内存分配的问题: 2422 浏览 1 关注 2 回答 0 评论

问使用lapa进行APA分析: 1255 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问请问下这种格式的R语言内容如何选择最小值: 1362 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 logistic回归、异常值: 1267 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问尿代谢组正负离子数据标准化是否可以均用正离子检测出来的肌酐峰: 1084 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 atac重复样品可视化: 1355 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 qpAdm结果解读: 1432 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 computeMatrix画图问题: 1805 浏览 1 关注 2 回答 0 评论

All Rights Reserved Powered BY WeCenter V4.1.0 © 2025