cox单因素分析问题 - 做专业的生信问答网站

登录

该问题已被锁定！

2: 关注

1446: 浏览

cox单因素分析问题

TCGA

想请问一下,在利用TCGA数据计算各基因与癌症的单因素分析时,是采用count数据还是FPKM数据还是转换成TPM进行计算,谢谢各位

好问题 0 评论收藏举报

1 回答

孟浩巍超级管理员用户来自于: 北京市
2018-08-31 12:58

目前提供的TCGA数据都是RSEM

赞同 0 2评论

关于作者

: Peer 初级会员
这家伙很懒，还没有设置简介

1: 回答

0: 文章

2: 问题

问题动态

发布时间: 2018-08-31 12:34

更新时间: 2018-08-31 12:58

关注人数: 2 人关注

相关问题

根据基因表达做生存分析OS取出最合适的cutoff: 1179 浏览 1 关注 0 回答 0 评论

GO、KEGG分析中的showCategory是按照什么顺序来输出对应的条目的: 2818 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

RNA-seq差异分析: 1848 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

在仅有每个样本(有3个repeat)所有转录本的fpkm的情况下，如何利用cuffdiff进行差异基因分析。: 2571 浏览 4 关注 3 回答 0 评论

GAPIT包FarmCPU和Blink模型进行GWAS分析报错: 2471 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

关于GO分析的问题: 1440 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

为什么差异基因分析会出现被KO的基因log2FC的数值大于1的情况: 2327 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

普通转录组的跨物种分析: 2319 浏览 1 关注 2 回答 0 评论

两次运行同一个FQ文件产生的bam文件分析结果存在差异: 1926 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

ROSE包分析Super Enhancer: 2162 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

推荐内容

问 TCGA数据下载: 1414 浏览 2 关注 1 回答 2 评论

问我的Rstudio所有的函数都是出现报错说没有某某某函数: 2336 浏览 5 关注 4 回答 0 评论

All Rights Reserved Powered BY WeCenter V4.1.0 © 2025