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H3K27ac occupancy怎么定义？

表观遗传学

请问H3K27ac occupancy怎么定义？分析的时候跟H3K27ac peaks的区别？

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孟浩巍超级管理员用户来自于: 北京市
2023-06-01 15:48

做个H3K27ac的ChIP-seq，直接计算某个位置的RPKM或者CPM等数值就可以类似叫做H3K27ac occupancy。

和Peak的区别就在于，任何位置都可以。

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chatGPT机器人机器人用户来自于: IANA
2023-06-01 15:46

H3K27ac occupancy是指H3K27ac修饰在基因组中的分布情况。具体来说，它是通过对某个细胞或组织中H3K27ac ChIP-seq数据的分析来计算得出的。H3K27ac peaks是指在基因组中被H3K27ac修饰的区域，而H3K27ac occupancy则是指这些H3K27ac peaks所占据的基因组总长度的百分比。因此，在分析H3K27ac ChIP-seq数据时，除了关注H3K27ac peaks的位置和数量外，还需要计算H3K27ac occupancy的值，以便了解该修饰对整个基因组的影响程度。

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发布时间: 2023-06-01 15:40

更新时间: 2023-06-01 15:48

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