信号通路特征基因集的查询？用于作ssGSEA分析。

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关于 截取某基因前后200bp片段

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一个cohort中，某基因count大于多少才有意义？

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基因组组装问题

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宏基因组注释率超低

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群体内同源基因的所有变异

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链特异性文库（mRNA/lncRNA/circRNA）如何将RNA类型分开？

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如果在基因组中鉴定到病毒序列，如何从生信角度判断它是EVEs还是HGTs

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怎么画snp密度在染色体上的分布图，例图如下

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菌侵染植物的转录组分析中，若菌的一个基因在当前时间没有引起植物基因的变化，过了三个小时后才引起植物基因的变化，如何分析这种现象或如何将这一类基因关联起来，有没有类似的文献推荐？

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问 尿代谢组正负离子数据标准化是否可以均用正离子检测出来的肌酐峰

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问 de novo mutation检测和判断

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问 sc-ATAC数据质控

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问 请问cytoscape是怎么构建网络的？

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问 logistic回归、异常值

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问 不同测序平台的scRNAseq数据集整合（10✖️、smart-seq）

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问 关于基因间的相关性分析

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问 HHblits使用相同的数据库，得出的结果明显差于HHpred网页版的结果。该如何使用HHsuite命令行得到与网页端类似的效果

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问 如何批量下载SRA数据库中的数据？

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问 RNA Seq中什么样的reads是chimeric reads？是不是多数的chimeric reads都是circRNA的？

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