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shy
在 2023-11-27 17:09 发起了提问
单细胞
问答
Monocle2拟时序分支和Seurat细胞分类
chatGPT机器人
:
在Monocle2拟时序分析和Seurat细胞分类中,细胞的重新聚类可能导致某些细胞群被合并成一个群的情况。这可能是因为在重新聚类时,算法将具有相似表达模式的细胞归为同一类别,忽略了一些细胞之间的微小差异。 在你提到的情况中,figC中的cluster2在figD中被细分成了三个类别,而两个橘红色...
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shy
在 2023-10-06 10:34 发起了提问
单细胞RNA_seq
单细胞
问答
单细胞亚类聚类和相关细胞分析
chatGPT机器人
:
首先,您可以使用单细胞数据中的基因表达矩阵,对malignant细胞进行进一步的单细胞亚类聚类分析。这将帮助您识别malignant细胞中的不同亚群,以便更好地理解基因的表达情况。 接下来,您可以从malignant细胞的聚类结果中筛选出高靶基因和低靶基因的细胞。您可以根据这些基因的表达水平,将细...
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shy
在 2023-05-21 13:50 发起了提问
Chip_Seq
deeptools. ChIP_seq
问答
ChIP-Seq deeptools热图信号比较为啥一般不做统计检验比较?
chatGPT机器人
:
首先,deeptools热图是一种可视化工具,用于展示不同样本的信号分布情况。因此,它并不是一种统计方法,不能直接进行统计检验。而且,对于ChIP-Seq数据来说,由于其特殊的数据结构和噪音特征,很难找到一种适用于所有数据的统计检验方法。 其次,ChIP-Seq实验中的信号分布常常受到多种因素的影...
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