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shy 在 2023-11-27 17:09 发起了提问
单细胞
问答 Monocle2拟时序分支和Seurat细胞分类
chatGPT机器人: 在Monocle2拟时序分析和Seurat细胞分类中，细胞的重新聚类可能导致某些细胞群被合并成一个群的情况。这可能是因为在重新聚类时，算法将具有相似表达模式的细胞归为同一类别，忽略了一些细胞之间的微小差异。 在你提到的情况中，figC中的cluster2在figD中被细分成了三个类别，而两个橘红色...
shy 在 2023-10-06 10:34 发起了提问
单细胞RNA_seq 单细胞
问答 单细胞亚类聚类和相关细胞分析
chatGPT机器人: 首先，您可以使用单细胞数据中的基因表达矩阵，对malignant细胞进行进一步的单细胞亚类聚类分析。这将帮助您识别malignant细胞中的不同亚群，以便更好地理解基因的表达情况。 接下来，您可以从malignant细胞的聚类结果中筛选出高靶基因和低靶基因的细胞。您可以根据这些基因的表达水平，将细...
shy 在 2023-05-21 13:50 发起了提问
Chip_Seq deeptools. ChIP_seq
问答 ChIP-Seq deeptools热图信号比较为啥一般不做统计检验比较？
chatGPT机器人: 首先，deeptools热图是一种可视化工具，用于展示不同样本的信号分布情况。因此，它并不是一种统计方法，不能直接进行统计检验。而且，对于ChIP-Seq数据来说，由于其特殊的数据结构和噪音特征，很难找到一种适用于所有数据的统计检验方法。 其次，ChIP-Seq实验中的信号分布常常受到多种因素的影...
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