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孟浩巍在 2023-07-15 18:03 回答了问题 转录组: 几个酶有许多共同基因，这些酶产物之间存在什么关系; 孟浩巍: 什么意思？举个具体的例子？; 赞同0 反对 0 人感谢 2 评论 2 回复

孟浩巍在 2023-07-07 12:49 回答了问题 三代测序: 三代重测序结合DNA甲基化的推荐文章; 孟浩巍: 三代重测序 + 甲基化测序，如果还三代 + 二代没啥优势啊。如果是三代直接读甲基化的信号，算法也很多了，你可以看看肖传乐老师的paper; 赞同0 反对 1 人感谢 0 评论 2 回复

孟浩巍在 2023-07-07 12:49 回答了问题 三代测序: 三代重测序结合DNA甲基化的推荐文章; 孟浩巍: 三代重测序 + 甲基化测序，如果还三代 + 二代没啥优势啊。如果是三代直接读甲基化的信号，算法也很多了，你可以看看肖传乐老师的paper; 赞同0 反对 1 人感谢 0 评论 2 回复

孟浩巍在 2023-07-03 19:02 回答了问题 单细胞RNA_seq: harmony整合样本前需要分别预处理吗？; 孟浩巍: 对所有样品一起。; 赞同0 反对 0 人感谢 0 评论 2 回复

孟浩巍在 2023-07-03 19:01 回答了问题 数据处理 基因组: bowtie2 参考基因组注释比对; 孟浩巍: 这个和你建index时候输入的fasta文件的标记有关系。如果里面染色体写的是chr1，chr2....这种的，那么你比对结果也就是chr1，chr2.... 如果当时fasta文件写的就是CM000663.2这种标记，那么你的比对结果也就是相对于的标记结果。如果为了省事，你直接从UCSC...; 赞同0 反对 0 人感谢 0 评论 2 回复

孟浩巍在 2023-06-30 00:07 回答了问题 生信分析: bowtie2比对报错（(ERR): bowtie2-align exited with value 1）; 孟浩巍: 大概率是内存不够，报错了。可以考虑是不是CPU和内存资源不够导致的。如果都不是上面的原因，比如只在某个文件运行的时候出问题，就一定要考虑是否可能是文件不完整。; 赞同0 反对 0 人感谢 0 评论 2 回复

孟浩巍在 2023-06-30 00:05 回答了问题 生信分析: ChIP-seq的bigwig文件可以使用rpkm>1过滤掉一些弱的信号吗？; 孟浩巍: 不建议这么操作，直接是什么样子就是什么样子。如果非要过滤，也是最后得到计算结果，在表格这个层面进行过滤。; 赞同0 反对 0 人感谢 0 评论 2 回复

孟浩巍在 2023-06-30 00:04 回答了问题 生信问题: 如何批量下载SRA数据库中的数据？; 孟浩巍: 只能500个为单位进行fetch和下载这个应该是NCBI自己API的规定，没办法。或者可以看看这个网站 https://sra-explorer.info/; 赞同1 反对 0 人感谢 0 评论 2 回复

孟浩巍在 2023-06-30 00:02 回答了问题 基因组: sgRNA的GC content 是什么意思，该如何计算; 孟浩巍: chatGPT回答已经挺好了。; 赞同0 反对 0 人感谢 1 评论 2 回复

孟浩巍在 2023-06-30 00:02 回答了问题 生信具体问题: 如何提取可变剪切位点？; 孟浩巍: 查一下rMATS这个软件。; 赞同0 反对 0 人感谢 0 评论 2 回复

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