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海王坑在 2018-09-08 11:27 回答了问题 问题求解: bowtie2使用报错，求助啦; 海王坑: 使用Bowtie2进行序列的比对，首先是要使用bowtie2-bulid生成参考序列的索引数据库，你的电脑在建库的时候内存不足，考虑换一台内存大的电脑或者用服务器去比对？; 赞同1 反对 0 人感谢 0 评论 3 回复

海王坑在 2018-09-07 23:44 回答了问题 生信入门: 基因互作网络和蛋白互作网络; 海王坑: http://stitch.embl.de/蛋白互作; 赞同1 反对 0 人感谢 1 评论 2 回复

海王坑在 2018-09-05 11:04 回答了问题 生物信息学 考研: 考研生物信息学院校推荐; 海王坑: 其实国内并没有很多纯粹的生物信息学学院吧，看你自己的定位，结合自己的基础。如果自己是上游学科的基础，比如数学专业等出身，可以考虑算法开发往国外找找信息，国内老师大部分的方向还是在基于一个具体的研究，需要使用生信作为一门技术手段去分析数据，大部分处于一个下游学科方向，这样的话选择就挺多的了; 赞同0 反对 1 人感谢 0 评论 3 回复

海王坑在 2018-09-05 10:55 回答了问题 生信入门: 【求助】差异表达和特异表达; 海王坑: 这个公式文章的链接能不能发一个我觉得可以同时用这两种方法分析，相互验证或者取个交集，再下结论是这些基因导致品系差别; 赞同1 反对 0 人感谢 1 评论 2 回复

海王坑在 2018-08-28 11:06 回答了问题 没事找事: 先埋一个帖子，希望一年之后大家都能收获到自己想要的。; 海王坑: 希望一年之后，我已经可以独立分析转录组数据，再自己可以独立挖坑。; 赞同0 反对 0 人感谢 0 评论 10 回复

海王坑在 2018-08-24 21:51 回答了问题 Cytoscape 生信分析 miRNA_mRNA互作分析: 测了实验组与对照组的mRNA与miRNA的转录组，miRNA-mRNA互作分析网络怎么处理呢？; 海王坑: 这个还是得基于具体的生物学意义去分析互作网络，去看别人文献吧; 赞同0 反对 0 人感谢 1 评论 2 回复

海王坑在 2018-08-24 08:38 回答了问题 芯片数据分析: 如何判断一篇CHIPseq的文章用的是hg19还是hg38; 海王坑: 正文没找到的话，看下附件; 赞同0 反对 0 人感谢 0 评论 3 回复

海王坑在 2018-08-23 23:53 回答了问题 生信入门: 亲问大家有没有chip-seq入门相关的教程？; 海王坑: 去看知乎Live 一听就明白; 赞同0 反对 0 人感谢 0 评论 5 回复

海王坑在 2018-08-23 12:26 回答了问题 没事找事: 论单身的重要性; 海王坑: ...; 赞同0 反对 0 人感谢 0 评论 6 回复

海王坑在 2018-08-23 12:24 回答了问题 GO分析 无参转录组: 请问无参转录组的GO分析如何进行; 海王坑: 大致策略是，先要拼接得到无参物种的全长转录本，以全长转录本作为参考分析表达量算Fpkm等，但Go注释的话，还得将无参转录本比对到近缘有参物种基因组，用有参物种来GO注释。; 赞同1 反对 0 人感谢 0 评论 6 回复

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