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孟浩巍
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先把生信坑能做够10年!
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孟浩巍
在 2023-05-16 23:33 发起了提问
测试
生信分析思路
问答
生信常见的分析目标有哪些呢?
chatGPT机器人
:
生信常见的分析目标包括以下几个方面: 基因组学分析:通过测序技术对生物个体的基因组进行测序,对其进行组装、注释和比对等分析,以研究序列特征、基因结构和功能等方面的信息。 转录组学分析:通过RNA测序技术对生物个体的转录组进行测序,对其进行定量、差异表达、剪接和功能注释等分析,以研究基因表达调...
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匿名用户
在 2023-05-16 21:52 回答了问题
生信分析
如何入坑
默认话题
生信行业目前薪资怎样?谈谈吧
孟浩巍
:
这两年不太行,不是个好光景,疫情后这几年不裁员就不错了。 疫情的时候,很多公司的工资也不是足额发放的。
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孟浩巍
在 2023-05-16 11:16 回答了问题
mapping
Picard fixmate是否有必要
孟浩巍
:
fixmate主要的用途是用来检测你的双端测序的另一端的比对情况。 再简单来说,双端测序比对以后,有可能一端比对上,另一端没有比对上; 之后没有比对上的reads可能在后面的过滤流程中被丢掉了, 这个时候其实你的双端测序只有1端了,这个时候就需要使用fixmate命令,否则不用。 一般在做自...
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孟浩巍
在 2018-10-12 20:02 回答了问题
CDS序列的批量下载
请问一下,如何根据基因名批量下载CDS区的序列?
孟浩巍
:
这个问题其实用UCSC genome browser里面的table browser 工具能够非常方便地解决。 [b]第1步,打开 UCSC genome browser里面的table browser;[/b] [url=https://genome.ucsc.edu/]https://gen...
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孟浩巍
在 2018-10-12 17:29 回答了问题
考研
想开始准备考研了,生物工程考生物信息
孟浩巍
:
我觉得还是先有目标院校吧~ 然后既然是考研,数学估计是考数学甲(高数,线代 ,概率论和数理统计),另外英语可以提前先准备一下。 选择目标院校以后,再说怎么准备吧~ 放心,群里肯定有你目标院校的师兄师姐,到时候问问他们。
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孟浩巍
在 2018-10-12 17:27 回答了问题
生信分析
二代测序
来自不同project的RNA-Seq数据可以直接合并分析吗?
孟浩巍
:
不建议合并,因为还是有batch的因素的。 关于batch effect的内容,我倒是建议你直接读读DESeq2和cuffdiff的原始paper,因为他们在写这个软件的时候,专门考虑过这个问题。
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孟浩巍
在 2018-10-12 17:26 回答了问题
生信入门
生物信息学
生信问题(我也不知道该怎么问)
孟浩巍
:
TCGA的样本数据可以下载下来,里面包含了年龄性别什么的,然后这个是自己整理的。
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孟浩巍
在 2018-10-12 17:25 回答了问题
rstudio_server
windows10子系统安装Rstudio-server失败
孟浩巍
:
都windows了…… 为啥不安个本地版的Rstudio?
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