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先把生信坑能做够10年！

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孟浩巍在 2023-05-19 20:10 回答了问题 bam: 从bam文件还能提取出来原来比对前的fastaq文件吗？; 孟浩巍: 就是BAM文件转fastq是可能的，但是就怕你这个BAM是经过过滤的，然后转出来的fastq文件是个原始输入文件的子集。; 赞同1 反对 0 人感谢 0 评论 2 回复

孟浩巍在 2023-05-18 14:35 回答了问题 WGCNA: WGCNA; 孟浩巍: 1. 从h图看，好像分模块问题不是很大。 2. 选择6， 7， 8我感觉都差不多； 3. 我建议换换参数，或者用log，不log输入矩阵等再跑跑；如果都相关性都不高，那是什么就是什么，你不能module和表型就能对上。; 赞同0 反对 0 人感谢 0 评论 2 回复

孟浩巍在 2023-05-18 14:32 回答了问题 数据库: CMAP LINCS 2020下载问题; 孟浩巍: 为啥我直接就能下载，我也没注册……; 赞同0 反对 0 人感谢 1 评论 3 回复

孟浩巍在 2023-05-18 11:21 回答了问题 测序序列: T to T测序中ONT测序起到的作用; 孟浩巍: 你说的这两个都有用。测DNA是为了拼基因组，测RNA就可以辅助基因的注释。; 赞同0 反对 0 人感谢 6 评论 2 回复

匿名用户在 2023-05-17 14:49 回答了问题 单细胞RNA_seq: 单细胞RNA-seq分析流程; 孟浩巍: 恐怖的chatGPT; 赞同3 反对 0 人感谢 0 评论 2 回复

孟浩巍在 2023-05-17 14:46 回答了问题 RNA_seq: 用atac-seq数据计算的TSS enrichment score; 孟浩巍: ChatGPT回答得挺好……; 赞同0 反对 0 人感谢 0 评论 2 回复

匿名用户在 2023-05-17 11:40 回答了问题 生信问题: 染色体号是罗马数字怎么写sh循环; 孟浩巍: 类似 for chr_name in chrI chrII chrIII chrIV do xxx done; 赞同0 反对 1 人感谢 0 评论 1 回复

孟浩巍在 2023-05-17 11:36 回答了问题 问题求解: 分析CRISPR 高通量筛选数据; 孟浩巍: 这种报错信息量比较小，看不出什么具体的问题。; 赞同0 反对 1 人感谢 1 评论 2 回复

匿名用户在 2023-05-16 21:52 回答了问题 生信分析 如何入坑 默认话题: 生信行业目前薪资怎样？谈谈吧; 孟浩巍: 这两年不太行，不是个好光景，疫情后这几年不裁员就不错了。疫情的时候，很多公司的工资也不是足额发放的。; 赞同4 反对 0 人感谢 0 评论 5 回复

孟浩巍在 2023-05-16 11:16 回答了问题 mapping: Picard fixmate是否有必要; 孟浩巍: fixmate主要的用途是用来检测你的双端测序的另一端的比对情况。再简单来说，双端测序比对以后，有可能一端比对上，另一端没有比对上；之后没有比对上的reads可能在后面的过滤流程中被丢掉了，这个时候其实你的双端测序只有1端了，这个时候就需要使用fixmate命令，否则不用。一般在做自...; 赞同3 反对 0 人感谢 1 评论 1 回复

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