宋亚丹 初级会员

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宋亚丹 在 2023-05-21 14:01 回答了问题
测试 生信分析思路 表观遗传学
表观遗传学的常用技术和研究策略都有哪些？
宋亚丹: hMeDIP-seq: 羟甲基化DNA免疫共沉淀测序，用5hmC抗体将羟甲基化的DNA片段拉下来，进行测序。除了一般fastqc质控，trimGalore质控，bowtie2比对，它还多了一步macs2找富集峰，也进行组间差异peak的寻找以及peak在基因上的注释（启动子区，内含子，外显子，utr...
宋亚丹 在 2023-05-21 11:19 回答了问题
转录组
转录组和代谢组联合分析的方法有那些？
宋亚丹: 1、生物学相关性：根据MetaCyc数据库里底物、酶、产物的对应关系，底物产物为代谢，酶的本质为蛋白，但可以研究其转录水平。当酶A可以催化底物a转化为产物b时，我们认为A（转录）,a,b（代谢）之间有生物学联系。具体方法参考cancer cell一篇文献Multi-omics analyses of...
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