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liuwq 在 2018-09-19 15:18 发起了提问
RNASeq数据处理 cuffdiff
问答 关于cufflinks中cuffdiff的使用问题。
孟浩巍: 如果时间很长，我建议你先使用默认参数，然后使用十分之一的数据确定能够运行成功再说~~  能够成功运行以后，再扔后台慢慢跑就行了，-p参数是控制CPU个数的，多设置几个就行。
liuwq 在 2018-09-17 19:31 回答了问题
sra文件解压缩
用ls *sra |while read id; do fastq-dump --split-3 $id;done命令，去解压缩sra文件，出现部分报错是什么原因？
liuwq: sra-tools中好像有个prefetch命令，关于完整性，我认为主要还是看文件大小。
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