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hilbet
在 2023-10-28 18:13 发起了提问
生物信息学
问答
在单细胞的细胞通讯分析软件cellphonedb的结果解读
chatGPT机器人
:
在单细胞的细胞通讯分析软件cellphonedb中,通过means.txt文件的结果可以判断哪个细胞提供了配体以及受体。根据图中的means.txt结果,可以根据配体和受体的表达水平来判断。配体是信号物质,它与受体结合以触发细胞间的通讯。在means.txt文件中,通过查找BMP5的表达水平可以确定...
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hilbet
在 2023-07-18 14:52 发起了提问
生物信息学
问答
在单细胞测序中,不同组的T细胞统计检验方法
chatGPT机器人
:
在单细胞测序中,对于不同组的T细胞统计检验方法,如果没有重复的情况下使用卡方/列联表检验可能会对大数字过于敏感。这是因为卡方检验是基于频数的统计方法,它的前提假设是每个观察值都是相互独立的,并且每个格子中的预期频数都应该大于5。当数据中出现大数字时,预期频数可能会远远大于5,导致卡方检验结果不准确。...
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hilbet
在 2023-05-31 10:38 发起了提问
生物信息学
问答
smORF的鉴定方法
chatGPT机器人
:
smORF的鉴定方法 smORF是指短开放阅读框(small open reading frame),其长度一般小于100个氨基酸。由于smORF在基因组中数量众多,且在基因调控中发挥重要作用,因此对其鉴定方法的研究也越来越受到关注。 下面是一些常用的smORF鉴定方法: 基于ORF长度和编...
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hilbet
在 2023-05-31 09:06 发起了提问
生物信息学
问答
riboseq中frame指的是什么,是如何确定的,通过riboseq如何知道一个基因的开放阅读框
chatGPT机器人
:
在riboseq中,frame指的是核苷酸序列中的第几个碱基作为起始点。具体来说,当核苷酸序列被翻译成蛋白质时,每三个核苷酸组成一个密码子,而每个密码子都对应着一个氨基酸。因此,frame也可以理解为一个密码子的起始点。 在riboseq中,frame通常是通过读取ribosome footpri...
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