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笨阿牛在 2023-06-06 17:58 回答了问题 单细胞RNA_seq: 单细胞分析中在umap聚类（seurat, scanpy)有调整群位置的参数吗？; 笨阿牛: 可以修改你的UMAP坐标，其实就是XY轴的信息，调整到你满意。带着这个坐标做velocity分析，即可。可能有点造假，但是我称为半监督聚类，嘿嘿。; 赞同0 反对 0 人感谢 0 评论 3 回复

笨阿牛在 2018-10-05 22:28 回答了问题 算法: 在N-W算法中，为什么忽略了从x状态道y状态的转化（xi对应到一个空位到yi对应一个空位的转化）; 笨阿牛: 试着回答一下吧！首先说一下结论：我觉得高歌老师关于MXY状态的定义可能有一些小问题。高歌老师定义的状态如下图： [attach]290[/attach] 而所给的状态转移示例如下图： [attach]291[/attach] 这里面没有X→Y的转换。按照高老师的讲解：X→Y的例子为： A-...; 赞同1 反对 0 人感谢 0 评论 2 回复

笨阿牛在 2018-09-28 09:53 回答了问题 生信入门: 想补充生信统计学知识; 笨阿牛: 这个问题太好了; 赞同1 反对 0 人感谢 0 评论 2 回复

笨阿牛在 2018-09-27 17:10 回答了问题 conda 安装deeptools conda: 请问一下，使用conda install deeptools之后，出现如下报错，如何解决呢？; 笨阿牛: 自问自答吧！ [size=14]conda clean --packages[/size] [size=14]输入上面的命令之后，再安装，居然就好了！完全摸不着头脑[/size]; 赞同1 反对 0 人感谢 2 评论 1 回复

笨阿牛在 2018-09-18 08:42 回答了问题 sra文件解压缩: 用ls *sra |while read id; do fastq-dump --split-3 $id;done命令，去解压缩sra文件，出现部分报错是什么原因？; 笨阿牛: 已经解决了，用的是aspera; 赞同1 反对 0 人感谢 0 评论 3 回复

笨阿牛在 2018-09-14 16:00 回答了问题 R: Rstudio安装R包时，出现unable to move temporary installation; 笨阿牛: 你这个是windows呀！那我试着用linux的角度来解释你的问题吧。你这个在linux里面，是没有权限进行文件的移动，解决方案是选择root用户进行安装。你的安装路径涉及到了可能影响windows系统安全的文件，所以系统需要你的管理员权限。你可以试试用管理员权限打开R软件，或者更改安装路径; 赞同2 反对 0 人感谢 3 评论 3 回复

笨阿牛在 2018-09-14 15:56 回答了问题 下载: axel，wget下载数据出错的问题，没头绪; 笨阿牛: 这个问题没有答案吗？ Amazing！！！有没有试过wget的时候，用断点继续下载的方式：wget -b -c -i [url=http://www.http://?]www.http://?[/url] 然后看一下wget.log，看你的下载是否是100%的。; 赞同1 反对 0 人感谢 1 评论 1 回复

笨阿牛在 2018-09-09 21:52 回答了问题 macs2 conda: 用conda 安装macs2，提示Solving environment: failed？; 笨阿牛: 你好！我觉得你的应该是conda源的问题，因为我刚刚用了一下conda install macs2,已经显示安装成功。你可以试试BBQ100里面的番外2，仔细看一下是否把所有该添加的源都添加了，这个应该是问题所在。; 赞同2 反对 0 人感谢 2 评论 1 回复

笨阿牛在 2018-09-08 22:24 回答了问题 Bioconductor R语言 软件安装: R语言安装"Rhtslib"软件包，出现如下报错怎么办？; 笨阿牛: 首先感谢一下孟神！这个问题 [size=14]这个方案应该是起作用的：linux终端里输入 MAKE="make -j8"。[/size] [size=14]但是我的问题好像是：[/size]lzma.h: No such file or directory error太多，我也不知道该怎么去解...; 赞同1 反对 0 人感谢 0 评论 2 回复

笨阿牛在 2018-09-07 10:51 回答了问题 RStudio: 服务器linux系统上安装Rstudio和相应配置问题？; 笨阿牛: 这个问题对于孟神来讲是很简单的！但是对于新手入门的话，还是需要一个感同身受的教程的。作为一个新手，我之前在网上搜教程，安装了一个不能绘图的12版本，又不会卸载，只能重装系统了，咳咳！这个问题和我之前提问的一样，我已经解决了！这个是别人提供的教程，亲测可行！ [url]https://www.rst...; 赞同0 反对 0 人感谢 4 评论 3 回复

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