我想用linux shell统计人类参考基因组中每个染色体的长度和所有染色体的总长度，编写bash脚本如下：

#!/bin/bash

# 函数用于计算每个染色体的总长度并保存到指定的输出文件中
# 使用方法：calculate_chromosome_lengths input_reference_file output_file
function calculate_chromosome_lengths {
    local reference_file="$1"  # 输入的FASTA文件路径
    local output_file="$2"  # 输出文件路径

    # 声明关联数组用于存储每个染色体的长度
    declare -gA chromosome_lengths
    echo "Chromosome    Chromosome_Length" > a.txt
    # 使用seqkit将FASTA文件转换为TAB格式，并提取染色体名称和序列信息
    seqkit fx2tab "$reference_file" | awk '{print $1"\t"$NF}' | grep -v chrKI | grep -v chrGL |
    while IFS=$'\t' read -r chromosome sequence; do
        # 统计染色体的长度
        length=${#sequence}
        chromosome_lengths["$chromosome"]=$length
        echo "Debug:  "$chromosome": ${chromosome_lengths["$chromosome"]}"
        echo ""$chromosome" ${chromosome_lengths["$chromosome"]}" >> a.txt
    done

    echo "Debug: Length of chr1: ${chromosome_lengths[chr1]}"   

    # 将结果输出到指定的输出文件中
    echo "Chromosome    Chromosome_Length" > "$output_file"
    for chromosome in "${!chromosome_lengths[@]}"; do
        echo "$chromosome       ${chromosome_lengths[$chromosome]}" >> "$output_file"
    done

    # 统计所有染色体的总长度，并将总长度添加在输出文件的最后一行
    total_length=0
    for length in "${chromosome_lengths[@]}"; do
        total_length=$((total_length + length))
    done
    echo "Total $total_length" >> "$output_file"
    echo "染色体长度统计已完成，并保存到 $output_file 文件中。"
}

# 使用示例：将FASTA文件作为第一个参数，输出文件作为第二个参数
if [[ $# -lt 2 ]]; then
    echo "请提供输入的FASTA文件和输出文件路径。"
    echo "使用方法：$0 input_reference_file output_file"
else
    calculate_chromosome_lengths "$1" "$2"
fi

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# 检测不出来bug的bug

我目前遇到的问题是echo "Debug: Length of chr1: ${chromosome_lengths[chr1]}" 这一步之前，数组chromosome_lengths输出正常，但是chromosome_lengths并没有传递到下一步，echo "Debug: Length of chr1: ${chromosome_lengths[chr1]}"的结果为： "Debug: Length of chr1:"。输出结果为空，请问为什么？