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bowtie2 参考基因组注释 比对

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孟浩巍 超级管理员 用户来自于: 北京市
2023-07-03 19:01

这个和你建index时候输入的fasta文件的标记有关系。

如果里面染色体写的是chr1,chr2....这种的,那么你比对结果也就是chr1,chr2....

如果当时fasta文件写的就是CM000663.2这种标记,那么你的比对结果也就是相对于的标记结果。

如果为了省事,你直接从UCSC上下载即可。

https://hgdownload.soe.ucsc.edu/downloads.html

 

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Zed999 注册会员

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发布时间
2023-07-03 16:15
更新时间
2023-07-03 19:01
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