该问题已被锁定!
2
关注
3159
浏览

bowtie2 参考基因组注释 比对

查看全部 2 个回答

孟浩巍 超级管理员 用户来自于: 北京市
2023-07-03 19:01

这个和你建index时候输入的fasta文件的标记有关系。

如果里面染色体写的是chr1,chr2....这种的,那么你比对结果也就是chr1,chr2....

如果当时fasta文件写的就是CM000663.2这种标记,那么你的比对结果也就是相对于的标记结果。

如果为了省事,你直接从UCSC上下载即可。

https://hgdownload.soe.ucsc.edu/downloads.html

 

关于作者

Zed999 注册会员

这家伙很懒,还没有设置简介

问题动态

发布时间
2023-07-03 16:15
更新时间
2023-07-03 19:01
关注人数
2 人关注

相关问题

宏基因组注释率超低
已经有不同材料的全基因组二代测序数据,查找是否存在某个已知基因?
基因组组装
如何根据现有序列找到它们在三代基因组的编号
单细胞——小鼠T细胞注释的markers
基因组组装问题
参考基因组添加外源基因序列进行比对
bowtie2比对结果报告best,以及aligned concordantly
怎么用prokka做批量注释
请问一下,我的噬菌体基因组fasta文件还是config打头的,是不是需要进一步拼接成scaffold?还是挑选最大的config进行后续分析?

推荐内容

关于对3dDNA产生的hic文件进行纠错的问题
本地blast最理想的结果是什么
基因组组装问题
获取所有基因的转录起始位点(TSS)
SMC++
SNP请教
the accessibility of sgRNA binding to the target site是什么意思,有详细解答嘛
修改代码:报错Error: strip arg must be None or str
Homer预测motif
module 'RNA' has no attribute 'fold_compound'
All Rights Reserved Powered BY WeCenter V4.1.0 © 2025