什么是nomalized read count，和RPKM是什么关系 - 做专业的生信问答网站

登录

该问题已被锁定！

2: 关注

2646: 浏览

什么是nomalized read count，和RPKM是什么关系

转录组比对

好问题 0 评论收藏举报

查看全部 2 个回答

孟浩巍超级管理员用户来自于: 北京市
2018-09-08 10:17

楼上你说的……有点问题的…… [size=14]normalized read count 主要是对测序量进行校正，比如1个case测了10M，1个case测了20M。最简单的办法就是直接对case 2 除以2，但是真实算的时候不是这么算的，有不同的方法。理由是，基因的表达量不是线性变化的。[/size]

赞同 1 1评论

关于作者

: 小赛尔 注册会员
这家伙很懒，还没有设置简介

1: 回答

0: 文章

3: 问题

问题动态

发布时间: 2018-09-07 13:13

更新时间: 2018-09-08 10:17

关注人数: 2 人关注

相关问题

为什么我在做go的时候，用clusterProfiler富集没有结果，但是用网站http://geneontology.org/ 做就有很多呢？代码如图: 2125 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

RNA-seq reads和表达量在转座子上的分布meta图: 1953 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

NIPT算出了z-score后想要基于z>3的值对Z值进行校正该用什么方法: 2414 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

scRNA-seq有什么推荐的监督聚类方式吗？: 2320 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

想问问大家有熟悉分子对接的吗，想问问蛋白-蛋白对接需要什么软件与操作: 1941 浏览 3 关注 1 回答 0 评论

为什么差异基因分析会出现被KO的基因log2FC的数值大于1的情况: 3047 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

在使用cutadapt出现了看不懂的报错，使用snakemake编写的代码和报错的log文件内容放在下面，希望大神解惑帮忙看看是出现了什么问题？: 2060 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

单细胞monocle3，路径很不对，有什么参数是值得调的吗: 3372 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

riboseq中frame指的是什么，是如何确定的，通过riboseq如何知道一个基因的开放阅读框: 2253 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

RNA-seq count值和fpkm值不对应: 3558 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

推荐内容

问链特异性文库（mRNA/lncRNA/circRNA）如何将RNA类型分开？: 2178 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 reads比对的统计: 1905 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问不同比对软件出的结果能进行比较吗？: 2004 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

All Rights Reserved Powered BY WeCenter V4.1.0 © 2025