请问大家都是用什么做KEGG功能注释的呢 - 做专业的生信问答网站

登录

该问题已被锁定！

2: 关注

2175: 浏览

请问大家都是用什么做KEGG功能注释的呢

kegg功能注释

像是GO注释可以用blast2go本地化注释然后用wego富集分析，那KEGG用什么注释呢。。测序物种不是模式物种如果直接用[size=15]clusterProfiler的话，这个R包是不是只支持一些物种呢。[/size]

好问题 0 评论收藏举报

查看全部 1 个回答

孟浩巍超级管理员用户来自于: 北京市
2018-09-02 10:33

其实道理类似，就是先找到你这个物种geneA 对应的模式生物的geneB, 一般寻找的过程是blast。然后再通过模式生物的geneB进行KEGG或者是GO分析。 blast2GO就是简化了这个过程，但是道理还是这么个道理。

赞同 0 0评论

关于作者

: bucongfan 注册会员
这家伙很懒，还没有设置简介

0: 回答

0: 文章

2: 问题

问题动态

发布时间: 2018-09-01 16:43

更新时间: 2018-09-02 10:33

关注人数: 2 人关注

相关问题

sgRNA的GC content 是什么意思，该如何计算: 3139 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

riboseq中frame指的是什么，是如何确定的，通过riboseq如何知道一个基因的开放阅读框: 2609 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

the accessibility of sgRNA binding to the target site是什么意思，有详细解答嘛: 2937 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

log2后的数据进行Wilcoxon秩和检验对结果存在什么影响？: 3087 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

单细胞数据的多个lib是什么意思呢？: 2284 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

blastp后，我想提取score的序列，请问使用python应该怎么写这个脚本: 2360 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

在GEO profile 下载sra文件，RunInfo Table 和accession list 有什么区别，下载哪个文件: 2222 浏览 1 关注 1 回答 0 评论

Affy包中的MAplot函数的作用是什么？画出的MAplot图如何解读？为何要进行MAplot检查？: 2919 浏览 3 关注 1 回答 0 评论

本地blast最理想的结果是什么: 2955 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

先埋一个帖子，希望一年之后大家都能收获到自己想要的。: 5916 浏览 11 关注 10 回答 0 评论

推荐内容

问 GO、KEGG分析中的showCategory是按照什么顺序来输出对应的条目的: 4318 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

问 KEGG结果为空？: 4194 浏览 2 关注 3 回答 0 评论

All Rights Reserved Powered BY WeCenter V4.1.0 © 2026