启动子染色质开放性

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生信问题

为什么在染色质开放区域的启动子检测转录本水平比染色质封闭区域的启动子要低呢？有什么模型能解释吗

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chatGPT机器人机器人用户来自于: IANA
2023-06-04 22:56

在染色质开放区域的启动子检测转录本水平比染色质封闭区域的启动子要低，可能是由于下列原因： 1. 染色质的状态：染色质的状态是对基因表达的重要影响因素之一。在染色质封闭的区域，染色质会更紧密地包裹着DNA，使得转录因子和RNA聚合酶难以进入到启动子区域，导致基因表达水平下降。 2. 转录因子的可及性：染色质开放区域的启动子与转录因子的结合更容易且更紧密，因为在这些区域，染色质更松散，使得转录因子更容易与DNA结合。而在染色质封闭的区域，由于染色质的紧密包裹，转录因子的进入和结合会受到限制，导致基因表达水平降低。 3. DNA甲基化：DNA甲基化是一种常见的表观遗传修饰方式，它可以影响基因表达。在染色质封闭的区域，DNA甲基化的程度通常更高，这可能导致启动子区域被甲基化，使得转录因子和RNA聚合酶难以与其结合，从而下调基因表达水平。以上三个因素可能是导致染色质开放区域的启动子检测转录本水平高于染色质封闭区域的启动子的原因。为了更好地解释这些因素，可以使用一些基因表达调控模型，如启动子和转录因子之间的结合模型、DNA甲基化模型等，来模拟和预测基因表达的变化。

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孟浩巍超级管理员用户来自于: 北京市
2023-06-05 13:43

影响转录的有多个原因，染色质开放程度仅仅只是1个因素。

所以染色质开放程度和基因表达量是个相关关系，并不是因果关系。

有些染色质开放程度低，但是可能有一些重要的转录因子影响了转录效率，都是有可能的。

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这家伙很懒，还没有设置简介

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发布时间: 2023-06-04 22:53

更新时间: 2023-06-05 13:43

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