双端测序的sra文件，经过fastq-dump --split-3，出现3个结果是什么原因？如下图 - 做专业的生信问答网站

登录

该问题已被锁定！

2: 关注

639: 浏览

双端测序的sra文件，经过fastq-dump --split-3，出现3个结果是什么原因？如下图

sra文件解压缩

所用命令， ls *sra |while read id; do fastq-dump --split-3 $id;done 这次确保所下文件完整。结果如图： [b]如何处理第三个文件呢？第三个文件有作用吗？[/b]

好问题 0 评论收藏举报

1 回答

孟浩巍超级管理员用户来自于: 北京市
2018-09-18 22:03

可能是提交数据的时候，单端和双端测序的数据混在一起了。建议后续分析的时候可以只用双端。

赞同 1 0评论

关于作者

: 笨阿牛 初级会员
这家伙很懒，还没有设置简介

14: 回答

0: 文章

17: 问题

问题动态

发布时间: 2018-09-18 10:01

更新时间: 2018-09-18 22:03

关注人数: 2 人关注

相关问题

奇异值分解在处理芯片数据时的意义是什么？: 651 浏览 1 关注 0 回答 0 评论

poor oligo synthesis怎么理解，是什么意思呢: 750 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

表观遗传学未来发展趋势是什么？: 661 浏览 1 关注 1 回答 0 评论

编写shell脚本的if循环如下，结果运行的时候出现如下报错？原因是什么？大家学习shell变程的时候推荐哪些视频教程呢: 540 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

riboseq中frame指的是什么，是如何确定的，通过riboseq如何知道一个基因的开放阅读框: 776 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

什么是nomalized read count，和RPKM是什么关系: 1033 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

网上下载的DNA sequence 为什么前面和后面有一段N是什么意思？: 689 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

求助服务器警报蜂鸣原因: 579 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

如何在20个蛋白序列里找3个motif: 466 浏览 2 关注 0 回答 0 评论

基因组文件中chrUn具体是什么意思呢: 568 浏览 0 关注 0 回答 1 评论

推荐内容

问用ls *sra |while read id; do fastq-dump --split-3 $id;done命令，去解压缩sra文件，出现部分报错是什么原因？: 1028 浏览 3 关注 3 回答 0 评论

All Rights Reserved Powered BY WeCenter V4.1.0 © 2024