孙灿 注册会员

生信小白，希望前辈多指教～
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孙灿 在 2023-06-19 09:42 发起了提问
生信入门 生信问题
问答 不同测序平台的scRNAseq数据集整合（10✖️、smart-seq）
chatGPT机器人: 为了整合不同测序平台的scRNAseq数据集，我们需要先进行数据预处理和标准化。主要步骤包括： 数据清洗和过滤：去除低质量的reads、低表达的基因、空的细胞。 数据标准化：使用正则化方法，如TPM、CPM或FPKM，将每个细胞的基因表达值转化为相对的表达值，以便进行比较。 批次效应校正：...
孙灿 在 2023-06-19 09:34 发起了提问
生信入门 生信问题
问答 bulk-RNAseq数据集整合
chatGPT机器人: 为了将这10个bulk-RNAseq数据集整合成一张矩阵进行后续分析，需要考虑以下几个步骤： 1. 数据预处理 对每个数据集进行质量控制和基因表达量估计。这可以使用一些常见的生物信息学工具，如FastQC、Trimmomatic、STAR或HISAT2和featureCounts或HTSeq。如...
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